81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3571 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  48.12 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  34.16 
 
 		 666 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  34.16 
 
 		 666 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  69.01 
 
 		 645 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  46.56 
 
 		 551 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  36.59 
 
 		 593 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  39.26 
 
 		 591 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  52.17 
 
 		 586 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  69.12 
 
 		 632 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  52.17 
 
 		 586 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  66.2 
 
 		 581 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  66.2 
 
 		 581 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  75 
 
 		 531 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  59.57 
 
 		 518 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  67.16 
 
 		 641 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  65.22 
 
 		 548 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  70.49 
 
 		 543 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  39.6 
 
 		 550 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  39.52 
 
 		 531 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  47.13 
 
 		 581 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  41.09 
 
 		 550 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  38.64 
 
 		 639 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  50 
 
 		 530 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  50 
 
 		 533 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  54.41 
 
 		 539 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  52.78 
 
 		 572 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.5 
 
 		 513 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  42.16 
 
 		 500 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  39.23 
 
 		 529 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  54.41 
 
 		 624 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  60.32 
 
 		 491 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  56.06 
 
 		 561 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  56.06 
 
 		 574 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  42.16 
 
 		 510 aa  93.2  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  31.49 
 
 		 514 aa  92.8  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  42.16 
 
 		 524 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  41.23 
 
 		 531 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  52.17 
 
 		 629 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  38.57 
 
 		 578 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  39.17 
 
 		 571 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  37.9 
 
 		 542 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  51.43 
 
 		 563 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  47.19 
 
 		 658 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  54.41 
 
 		 643 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  42.16 
 
 		 555 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  38.56 
 
 		 528 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  31.94 
 
 		 543 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  42.16 
 
 		 188 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  54.55 
 
 		 622 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  54.41 
 
 		 604 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  37.04 
 
 		 475 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  45.74 
 
 		 561 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.94 
 
 		 518 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  47.44 
 
 		 544 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  48.57 
 
 		 606 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  50 
 
 		 600 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  34.62 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  33.59 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  41.79 
 
 		 589 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1650  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.508409  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  33.63 
 
 		 450 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2359  hypothetical protein  36.9 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0295348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  40 
 
 		 1821 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  32.35 
 
 		 515 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  32.35 
 
 		 515 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  35.38 
 
 		 508 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  40.74 
 
 		 506 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  28.75 
 
 		 784 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  27.47 
 
 		 400 aa  45.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  38.46 
 
 		 548 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  35.09 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  52.78 
 
 		 575 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2593  hypothetical protein  29.63 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  26.58 
 
 		 400 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  36.36 
 
 		 536 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  32.79 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  33.33 
 
 		 414 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  42.59 
 
 		 946 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>