42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3563 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  98.67 
 
 
528 aa  1050    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  39.89 
 
 
532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  37.67 
 
 
533 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  37.48 
 
 
533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  37.22 
 
 
546 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  35.87 
 
 
526 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  36.21 
 
 
517 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  35.33 
 
 
535 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  34.09 
 
 
547 aa  230  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  32.95 
 
 
546 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  32.95 
 
 
546 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  30.43 
 
 
543 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  27.62 
 
 
569 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  28.83 
 
 
605 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  29.58 
 
 
592 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  29.58 
 
 
592 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  30.69 
 
 
557 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29.87 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  26.52 
 
 
516 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  26.52 
 
 
516 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  26.52 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  26.52 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  29.74 
 
 
531 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  24.37 
 
 
507 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  26.52 
 
 
516 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25.33 
 
 
531 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  28.93 
 
 
534 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  29.23 
 
 
529 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  24.89 
 
 
616 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  29.35 
 
 
544 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
513 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  25.44 
 
 
558 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  25.29 
 
 
558 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  24.77 
 
 
729 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
510 aa  47.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  23.17 
 
 
726 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  30.25 
 
 
588 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.41 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  21.07 
 
 
564 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  27.98 
 
 
523 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  24.46 
 
 
563 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>