159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3443 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  90.92 
 
 
584 aa  1042    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
639 aa  1292    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  54.47 
 
 
580 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  45.4 
 
 
568 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  46.97 
 
 
595 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  43.86 
 
 
588 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  45.59 
 
 
568 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  45.45 
 
 
608 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  41.39 
 
 
585 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  44.59 
 
 
595 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.23 
 
 
1349 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.95 
 
 
1570 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.05 
 
 
1391 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  35.93 
 
 
584 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  29.82 
 
 
692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.81 
 
 
585 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  31.33 
 
 
587 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.79 
 
 
533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  25.67 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.05 
 
 
558 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.34 
 
 
561 aa  120  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.18 
 
 
567 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  24.61 
 
 
574 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  24.46 
 
 
554 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  25.66 
 
 
553 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.84 
 
 
561 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  24.33 
 
 
599 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  24.29 
 
 
543 aa  98.2  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.75 
 
 
607 aa  97.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  24.67 
 
 
550 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.22 
 
 
583 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.89 
 
 
572 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  24.19 
 
 
550 aa  94.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.4 
 
 
554 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.91 
 
 
554 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  34.01 
 
 
143 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.84 
 
 
596 aa  90.5  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.84 
 
 
596 aa  90.5  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  23.51 
 
 
531 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.2 
 
 
554 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  24.84 
 
 
596 aa  88.2  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.71 
 
 
573 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.04 
 
 
558 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.96 
 
 
585 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  21.52 
 
 
544 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.79 
 
 
569 aa  84.7  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  21.18 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.77 
 
 
692 aa  84  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.69 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.73 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  28.66 
 
 
557 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.41 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  21.49 
 
 
547 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.24 
 
 
747 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.08 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.14 
 
 
585 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.24 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  22.13 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  22.13 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  21.58 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.58 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.73 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.54 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  24.74 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  23.36 
 
 
567 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.73 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  22.58 
 
 
555 aa  73.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  24.57 
 
 
575 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.34 
 
 
561 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  22.42 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.87 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.05 
 
 
558 aa  71.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  32.74 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.26 
 
 
552 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.3 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.41 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  23.92 
 
 
583 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.17 
 
 
608 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.2 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.96 
 
 
561 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.48 
 
 
576 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  21.24 
 
 
597 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.38 
 
 
549 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.11 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  23.3 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.52 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.48 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  23.12 
 
 
602 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  21.53 
 
 
565 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.3 
 
 
568 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.52 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  21.53 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  22.54 
 
 
607 aa  67  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.33 
 
 
592 aa  67  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.52 
 
 
561 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  16.9 
 
 
554 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  18.22 
 
 
554 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  23.09 
 
 
593 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  21.05 
 
 
551 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.3 
 
 
587 aa  64.3  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>