More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3418 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  73.44 
 
 
678 aa  1021    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  51.84 
 
 
690 aa  709    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.02 
 
 
670 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  51.55 
 
 
690 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  66.17 
 
 
676 aa  927    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.61 
 
 
696 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.57 
 
 
680 aa  767    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.84 
 
 
680 aa  778    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  47.16 
 
 
672 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.04 
 
 
679 aa  847    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  97.77 
 
 
674 aa  1325    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  63.3 
 
 
684 aa  884    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.92 
 
 
774 aa  865    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.57 
 
 
670 aa  650    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.38 
 
 
738 aa  858    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.15 
 
 
697 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  49.4 
 
 
670 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 
674 aa  1384    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  46.71 
 
 
672 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  45.66 
 
 
688 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.55 
 
 
669 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  45.66 
 
 
688 aa  617  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  46.41 
 
 
663 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  47.5 
 
 
684 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.02 
 
 
669 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  46.1 
 
 
659 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  46.41 
 
 
673 aa  609  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.93 
 
 
669 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.71 
 
 
669 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.71 
 
 
669 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.78 
 
 
669 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.86 
 
 
669 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.93 
 
 
669 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.71 
 
 
669 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.71 
 
 
669 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.93 
 
 
669 aa  608  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.56 
 
 
670 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  45.66 
 
 
663 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.11 
 
 
671 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  47.37 
 
 
662 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.26 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.26 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.11 
 
 
671 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  47.39 
 
 
683 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  44.82 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  45.61 
 
 
677 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.96 
 
 
671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  46.78 
 
 
673 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  44.82 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.37 
 
 
671 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.83 
 
 
671 aa  601  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  46.68 
 
 
718 aa  600  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  44.51 
 
 
673 aa  600  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 
685 aa  601  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  46.61 
 
 
681 aa  596  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  46.15 
 
 
712 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  45.65 
 
 
668 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  46.96 
 
 
690 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  46.05 
 
 
726 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 
671 aa  595  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 
670 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  46.91 
 
 
683 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  45.45 
 
 
673 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  46.93 
 
 
666 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  45.56 
 
 
706 aa  595  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.52 
 
 
671 aa  595  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.37 
 
 
671 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.21 
 
 
671 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  43.61 
 
 
665 aa  590  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  44.8 
 
 
708 aa  591  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.36 
 
 
711 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.21 
 
 
671 aa  591  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  45.21 
 
 
671 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  45.44 
 
 
690 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.44 
 
 
671 aa  591  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 
670 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  46.72 
 
 
690 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  45.86 
 
 
673 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 
691 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  45.71 
 
 
682 aa  586  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  45.8 
 
 
688 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  46.2 
 
 
671 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  46 
 
 
691 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  45.36 
 
 
671 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  44.96 
 
 
675 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.06 
 
 
671 aa  588  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  45.05 
 
 
668 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.82 
 
 
673 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  46.1 
 
 
688 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.25 
 
 
670 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.25 
 
 
670 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  45.13 
 
 
683 aa  585  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  46.14 
 
 
746 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  45.05 
 
 
661 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  46.14 
 
 
691 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.29 
 
 
694 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  46 
 
 
691 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  44.83 
 
 
668 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 
669 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 
708 aa  584  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>