More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3326 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.2 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  28.22 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  27.91 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  29.2 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  28.97 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.9 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  26.77 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  31.74 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  29.29 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003864  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  28.57 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.013707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  28.34 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.8 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  24.5 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  25 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  26.27 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  26.27 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  26.27 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  25.91 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  27.67 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.61 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.19 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.71 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.27 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  27.84 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.58 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.54 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  24.02 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4782  short chain dehydrogenase  26.09 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  26.02 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.31 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.93 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.78 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.29 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  27.15 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>