More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3303 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  65.33 
 
 
228 aa  287  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2144  RNAse III  52.84 
 
 
233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  45.45 
 
 
246 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  45.45 
 
 
246 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3081  ribonuclease III  50.25 
 
 
228 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.569411  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4580  ribonuclease III  46.41 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  42.79 
 
 
246 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  41.74 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.5 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  45.12 
 
 
233 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.18 
 
 
246 aa  168  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  43.5 
 
 
237 aa  168  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  44.66 
 
 
241 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.33 
 
 
235 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  40.52 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  43.93 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.82 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42.73 
 
 
245 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  41.52 
 
 
234 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.64 
 
 
259 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.45 
 
 
236 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  40.45 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.36 
 
 
221 aa  161  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  42.34 
 
 
236 aa  161  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  41.36 
 
 
229 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  39.91 
 
 
377 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.91 
 
 
240 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  39.82 
 
 
240 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40.64 
 
 
238 aa  157  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.86 
 
 
240 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.6 
 
 
229 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.82 
 
 
237 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  39.45 
 
 
245 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.01 
 
 
236 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  42.52 
 
 
262 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  40.78 
 
 
385 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  43.89 
 
 
228 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.01 
 
 
243 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.01 
 
 
243 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.73 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  40.27 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  38.64 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  40.45 
 
 
227 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  36.57 
 
 
231 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.82 
 
 
233 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  37.44 
 
 
245 aa  153  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  41.5 
 
 
383 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  41.5 
 
 
383 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  41.36 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  40.1 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  39.46 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  42.73 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  42.72 
 
 
237 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  42.51 
 
 
249 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.73 
 
 
242 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.55 
 
 
230 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  39.73 
 
 
225 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  39.82 
 
 
225 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  39.29 
 
 
246 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.46 
 
 
248 aa  148  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.05 
 
 
246 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  35.75 
 
 
273 aa  148  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  38.91 
 
 
228 aa  148  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  38.83 
 
 
245 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  38.83 
 
 
245 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  38.83 
 
 
245 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  38.83 
 
 
245 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  38.83 
 
 
245 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  42.44 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  38.99 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  36.99 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  37.44 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  40.38 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.39 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  40.27 
 
 
260 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.5 
 
 
223 aa  146  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  38.71 
 
 
276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  42.35 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.44 
 
 
222 aa  145  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  38.54 
 
 
225 aa  145  6e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  41.88 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  40.64 
 
 
243 aa  144  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  39.37 
 
 
227 aa  144  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  39.17 
 
 
256 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  38.29 
 
 
224 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  37.33 
 
 
231 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  39.42 
 
 
248 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  39.42 
 
 
248 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  37.84 
 
 
225 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>