17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3287 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  100 
 
 		 197 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  100 
 
 		 197 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  29.61 
 
 		 568 aa  85.1  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  30.3 
 
 		 559 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  25.85 
 
 		 574 aa  74.7  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  25 
 
 		 555 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  24.86 
 
 		 606 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  23.45 
 
 		 551 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  23.6 
 
 		 541 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  23.24 
 
 		 549 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  25 
 
 		 551 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  23.08 
 
 		 563 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  25.5 
 
 		 578 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  23.08 
 
 		 563 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.71 
 
 		 579 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  24.79 
 
 		 550 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  30.23 
 
 		 527 aa  41.2  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>