271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3111 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1008 aa  2004    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  50.69 
 
 		 1007 aa  897    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  50 
 
 		 1008 aa  945    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  56.69 
 
 		 1007 aa  1046    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  46.32 
 
 		 1016 aa  844    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  47.07 
 
 		 1003 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  99.01 
 
 		 1008 aa  1990    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  29.01 
 
 		 1019 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  28.94 
 
 		 1022 aa  357  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  28.11 
 
 		 1031 aa  347  8.999999999999999e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  28.17 
 
 		 1022 aa  343  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  31.94 
 
 		 1023 aa  233  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  30.98 
 
 		 859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  30.15 
 
 		 859 aa  189  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  33.06 
 
 		 859 aa  183  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  36.89 
 
 		 857 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  22.05 
 
 		 993 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  27.98 
 
 		 1000 aa  101  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  26.04 
 
 		 891 aa  101  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  21.27 
 
 		 993 aa  95.5  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.31 
 
 		 978 aa  93.6  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 994 aa  90.9  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.37 
 
 		 895 aa  89  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.56 
 
 		 924 aa  88.2  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  22.12 
 
 		 1009 aa  87.4  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  30.11 
 
 		 910 aa  87.4  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  31.32 
 
 		 891 aa  87  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.89 
 
 		 902 aa  85.9  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.19 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  21.38 
 
 		 993 aa  79.7  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.74 
 
 		 906 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.69 
 
 		 890 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  20.86 
 
 		 1057 aa  73.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  28.89 
 
 		 912 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  23.65 
 
 		 1029 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  23.93 
 
 		 1009 aa  72.4  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  23.93 
 
 		 1009 aa  72.4  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  25.29 
 
 		 1039 aa  72.4  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  28.09 
 
 		 1108 aa  72  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.17 
 
 		 904 aa  71.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  26.23 
 
 		 961 aa  71.2  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  23.37 
 
 		 1029 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.85 
 
 		 1074 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.91 
 
 		 858 aa  70.1  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  22.78 
 
 		 995 aa  69.3  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.5 
 
 		 1019 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  23.01 
 
 		 1029 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  21.71 
 
 		 1061 aa  68.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  22.78 
 
 		 1029 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  22.77 
 
 		 1029 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  29.44 
 
 		 1172 aa  68.2  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  20.85 
 
 		 638 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  23.37 
 
 		 1029 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.67 
 
 		 1029 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  29.44 
 
 		 1172 aa  67.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28 
 
 		 1029 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  28 
 
 		 1029 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22.41 
 
 		 693 aa  65.9  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  31.86 
 
 		 1018 aa  65.5  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  22.1 
 
 		 1029 aa  65.1  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.14 
 
 		 789 aa  65.1  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  22.1 
 
 		 1029 aa  65.1  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  26.98 
 
 		 1180 aa  65.1  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.74 
 
 		 1020 aa  64.7  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 810 aa  64.7  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  26.02 
 
 		 1011 aa  64.7  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  29.92 
 
 		 1291 aa  64.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.74 
 
 		 1091 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.7 
 
 		 1013 aa  63.9  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  33.66 
 
 		 1018 aa  64.3  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  21.85 
 
 		 1059 aa  63.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  27.42 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  28.02 
 
 		 1165 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  31.86 
 
 		 1018 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  29.25 
 
 		 1155 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  28.63 
 
 		 1020 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  31.86 
 
 		 1018 aa  62.4  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.42 
 
 		 851 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  31.68 
 
 		 1018 aa  62.4  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  28.04 
 
 		 1219 aa  62  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  30.61 
 
 		 1234 aa  62  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  30 
 
 		 1223 aa  62  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  61.6  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 1165 aa  61.6  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  61.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  32 
 
 		 1018 aa  61.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  31.69 
 
 		 986 aa  61.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  31.25 
 
 		 1047 aa  60.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  29.46 
 
 		 1081 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  30.97 
 
 		 1020 aa  60.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  26.19 
 
 		 824 aa  60.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  28.44 
 
 		 1214 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  26.15 
 
 		 1083 aa  60.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  27.92 
 
 		 888 aa  60.1  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  32.5 
 
 		 1046 aa  60.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  26.39 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>