284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3108 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
448 aa  912    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
448 aa  912    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  79.46 
 
 
445 aa  735    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  67.79 
 
 
445 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  68.53 
 
 
447 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  37.88 
 
 
462 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  39.53 
 
 
463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  38.7 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  36.16 
 
 
491 aa  296  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  37.05 
 
 
458 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  35.64 
 
 
507 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  35.01 
 
 
464 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  37.93 
 
 
436 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  33.85 
 
 
446 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  33.19 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  31.28 
 
 
467 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  35.06 
 
 
466 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  35.28 
 
 
444 aa  245  9e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  34.62 
 
 
474 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  35.07 
 
 
476 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  35.79 
 
 
469 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  35.2 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  31.12 
 
 
446 aa  220  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  33.26 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  33.26 
 
 
451 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  31.93 
 
 
443 aa  209  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.4 
 
 
449 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  32.62 
 
 
437 aa  206  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  30.79 
 
 
437 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  30.79 
 
 
437 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.35 
 
 
455 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.28 
 
 
455 aa  202  8e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  33.33 
 
 
744 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  30.94 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.05 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  30.93 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  32.05 
 
 
441 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.18 
 
 
452 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  31.4 
 
 
456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  30.72 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.66 
 
 
445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  30.94 
 
 
412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  32.71 
 
 
430 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  32.09 
 
 
472 aa  173  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  29.4 
 
 
418 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  29.95 
 
 
418 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  30.7 
 
 
411 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  31.7 
 
 
424 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  32.8 
 
 
429 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  30.73 
 
 
394 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.12 
 
 
445 aa  153  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  29.17 
 
 
412 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  32.1 
 
 
410 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  31.01 
 
 
421 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  29.24 
 
 
415 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  29.54 
 
 
420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  28.27 
 
 
408 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  27.88 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  27.88 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  30.42 
 
 
417 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  29.9 
 
 
416 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  28.68 
 
 
425 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  28.21 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  27.77 
 
 
425 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  26.84 
 
 
406 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  26.62 
 
 
408 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  27.01 
 
 
470 aa  116  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2414  Mur ligase family protein  27.13 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00339863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.28 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000060186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate ligase  25.71 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00917658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.18 
 
 
493 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0773  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  25.78 
 
 
486 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.03528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.15 
 
 
455 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.95 
 
 
455 aa  60.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2013  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  26.03 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  30.13 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.59 
 
 
468 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.81 
 
 
479 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.55 
 
 
491 aa  57.4  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04741  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  23.05 
 
 
511 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.712955  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04321  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  22.71 
 
 
511 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0676  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.78 
 
 
462 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0583  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.02 
 
 
464 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000310292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0234  UDP-N-acetylmuramate  33.1 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2093  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  31.48 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.66 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3262  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.79 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3633  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  24.82 
 
 
458 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0359  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.17 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1956  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  26.26 
 
 
490 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04631  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  23.68 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0849  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  30.41 
 
 
474 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0409  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25 
 
 
462 aa  53.5  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0959029  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2115  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  23.77 
 
 
523 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0408  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  22.88 
 
 
511 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.966635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.1 
 
 
449 aa  53.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3825  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  27.12 
 
 
462 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2094  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  28.47 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0467874  hitchhiker  0.00000530734 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1105  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  26.38 
 
 
536 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.933873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0480  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  23.15 
 
 
459 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000047898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>