More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3022 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.66 
 
 
950 aa  725    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  38.78 
 
 
3494 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 
1955 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  30.15 
 
 
1577 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  38.59 
 
 
2126 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  31.1 
 
 
1520 aa  659    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  40.02 
 
 
1966 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  39.7 
 
 
2047 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  32.59 
 
 
4268 aa  741    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.39 
 
 
6889 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  30.78 
 
 
1537 aa  688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  34.85 
 
 
3045 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  37.74 
 
 
2066 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  41.56 
 
 
2367 aa  680    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  41.23 
 
 
7210 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  38.35 
 
 
3463 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.13 
 
 
2316 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 
3711 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.65 
 
 
3099 aa  735    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  41.55 
 
 
4080 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
2551 aa  1198    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.42 
 
 
1874 aa  1051    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  51.98 
 
 
1656 aa  961    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  46.81 
 
 
1144 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  53.21 
 
 
1587 aa  1017    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  54.23 
 
 
1087 aa  992    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.56 
 
 
3130 aa  857    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  50.28 
 
 
1337 aa  886    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  54.28 
 
 
1349 aa  1035    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  44.42 
 
 
3099 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  41.01 
 
 
3252 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  31.69 
 
 
1574 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.86 
 
 
1939 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 
1832 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 
3033 aa  803    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  40.71 
 
 
1208 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 
2081 aa  815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1559 aa  3219    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  40.47 
 
 
4165 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 
5400 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  39.89 
 
 
3718 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  39.78 
 
 
1114 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  32.64 
 
 
3493 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  44.48 
 
 
3693 aa  807    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  39.89 
 
 
2376 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  30.87 
 
 
1520 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.47 
 
 
1804 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  31.85 
 
 
4646 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 
1658 aa  669    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  99.29 
 
 
1559 aa  3194    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  31.97 
 
 
1612 aa  662    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  48.42 
 
 
2551 aa  891    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  47.06 
 
 
1909 aa  802    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  51.97 
 
 
1354 aa  990    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  40.37 
 
 
2374 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  38.62 
 
 
2225 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 
2985 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  47.45 
 
 
3176 aa  867    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 
2232 aa  751    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 
2880 aa  956    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  46.44 
 
 
4478 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.97 
 
 
1372 aa  806    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  41.82 
 
 
3254 aa  737    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  46.85 
 
 
2762 aa  1289    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  44.48 
 
 
3693 aa  807    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  32.2 
 
 
1584 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  30.87 
 
 
1520 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 
1816 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  30.9 
 
 
1582 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
7110 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.92 
 
 
7279 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.07 
 
 
3676 aa  978    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  42.79 
 
 
2477 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.74 
 
 
3696 aa  996    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.21 
 
 
2890 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
3092 aa  863    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  34.76 
 
 
1653 aa  706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3100  Acyl transferase  53.43 
 
 
866 aa  733    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304625  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  54.7 
 
 
1349 aa  1039    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  31.91 
 
 
1612 aa  662    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.89 
 
 
1867 aa  670    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 
5154 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.4 
 
 
4151 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  30.04 
 
 
4647 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  34.32 
 
 
3449 aa  820    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  39.2 
 
 
2113 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  46.39 
 
 
3645 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  33.54 
 
 
3158 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.86 
 
 
1789 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  44.15 
 
 
3702 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  39.09 
 
 
2604 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  44.8 
 
 
3337 aa  777    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  43.5 
 
 
2230 aa  755    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
2333 aa  691    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  38.28 
 
 
2024 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  45.47 
 
 
2462 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  40.79 
 
 
1602 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 
1548 aa  871    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.57 
 
 
3679 aa  981    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  38.81 
 
 
1071 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>