More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2793 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  97.26 
 
 
331 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
727 aa  1499    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  40.95 
 
 
324 aa  226  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  38.58 
 
 
338 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.46 
 
 
328 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  39.63 
 
 
327 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  40.37 
 
 
329 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  38.84 
 
 
305 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  35.9 
 
 
419 aa  208  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  37.89 
 
 
320 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  36.47 
 
 
416 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  37.39 
 
 
416 aa  197  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  36.99 
 
 
320 aa  197  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  35.59 
 
 
415 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.4 
 
 
418 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  36.97 
 
 
318 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  37.69 
 
 
336 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  33.92 
 
 
426 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  37.35 
 
 
311 aa  193  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  33.43 
 
 
428 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  35.51 
 
 
417 aa  187  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  36.36 
 
 
417 aa  185  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  37.39 
 
 
323 aa  180  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  36.73 
 
 
437 aa  178  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  34.83 
 
 
425 aa  177  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  32.68 
 
 
436 aa  174  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
417 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  35.21 
 
 
424 aa  170  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  50.3 
 
 
438 aa  169  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.67 
 
 
451 aa  167  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  33.43 
 
 
406 aa  167  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  30.68 
 
 
657 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 
487 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  34.85 
 
 
491 aa  165  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  33.42 
 
 
474 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.21 
 
 
329 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.88 
 
 
350 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 
350 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  35.69 
 
 
319 aa  160  8e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  33.61 
 
 
417 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 
423 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.05 
 
 
423 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  33.43 
 
 
447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.01 
 
 
348 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  40.7 
 
 
460 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  40.7 
 
 
460 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
427 aa  144  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  38.89 
 
 
467 aa  144  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.93 
 
 
313 aa  144  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  33.98 
 
 
472 aa  144  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  34.25 
 
 
472 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  31.85 
 
 
373 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  34.25 
 
 
472 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  34.44 
 
 
472 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  33.98 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  34.25 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  33.98 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
490 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
350 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  33.15 
 
 
471 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  42.33 
 
 
413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
476 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
476 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
476 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  32.6 
 
 
476 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  32.6 
 
 
476 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  28.11 
 
 
315 aa  136  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  40.85 
 
 
483 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
335 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  29.33 
 
 
495 aa  134  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
456 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
444 aa  132  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
328 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
456 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  38.55 
 
 
406 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 
334 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.27 
 
 
313 aa  126  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 
310 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
379 aa  120  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.84 
 
 
345 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
359 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  26.82 
 
 
352 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  35.42 
 
 
239 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.46 
 
 
468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
335 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 
321 aa  114  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 
398 aa  114  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.16 
 
 
435 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
389 aa  114  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
318 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  25.7 
 
 
409 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 
418 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.3 
 
 
357 aa  109  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
337 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.84 
 
 
370 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
313 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>