95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2703 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 
880 aa  1807    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  99.66 
 
 
880 aa  1803    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  44.84 
 
 
825 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  41.05 
 
 
778 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  33.6 
 
 
447 aa  200  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  47.15 
 
 
1016 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  47.15 
 
 
1016 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  41.28 
 
 
947 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  40 
 
 
1048 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  41.47 
 
 
1348 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  38.15 
 
 
402 aa  154  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  42.15 
 
 
1373 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  38.67 
 
 
1279 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  38.22 
 
 
1279 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  37.5 
 
 
1363 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  36.28 
 
 
1656 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  29.67 
 
 
544 aa  96.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  25.25 
 
 
670 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  27.95 
 
 
1046 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5547  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.09 
 
 
747 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.653518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.44 
 
 
778 aa  84.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  26.73 
 
 
715 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  21.05 
 
 
844 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  22.72 
 
 
800 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  20.34 
 
 
737 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  37.36 
 
 
367 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  22.73 
 
 
721 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  30 
 
 
762 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  30 
 
 
762 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  25.71 
 
 
799 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  26.35 
 
 
773 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  28.79 
 
 
570 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.91 
 
 
725 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  36.08 
 
 
598 aa  60.8  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4531  hypothetical protein  45.45 
 
 
73 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  21.77 
 
 
481 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.28 
 
 
818 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4040  hypothetical protein  61.36 
 
 
72 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.980634  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  34.07 
 
 
1611 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.16 
 
 
908 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1904  hypothetical protein  20.79 
 
 
772 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.51395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.24 
 
 
1438 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.6 
 
 
1150 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.69 
 
 
766 aa  54.7  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  36.99 
 
 
303 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.83 
 
 
951 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  23.49 
 
 
841 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.94 
 
 
1183 aa  54.3  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  41.33 
 
 
796 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  24.9 
 
 
923 aa  53.5  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  31.33 
 
 
266 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  24.82 
 
 
1186 aa  51.6  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  25.56 
 
 
485 aa  51.6  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.23 
 
 
649 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
398 aa  51.2  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  28.42 
 
 
374 aa  51.2  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.9 
 
 
805 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  29.36 
 
 
137 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
398 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
1526 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.32 
 
 
1343 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.46 
 
 
872 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 
517 aa  49.3  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  20.85 
 
 
1203 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  26.97 
 
 
1581 aa  49.3  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.77 
 
 
1237 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  38.75 
 
 
272 aa  48.9  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1132  hypothetical protein  26.79 
 
 
556 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.255405  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  31.17 
 
 
358 aa  47.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.71 
 
 
490 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.67 
 
 
1216 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  26 
 
 
647 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.52 
 
 
951 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  30.34 
 
 
286 aa  47.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
1818 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.68 
 
 
1094 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  28.37 
 
 
801 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  25 
 
 
960 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  24.84 
 
 
1002 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  23.53 
 
 
1492 aa  45.8  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  23 
 
 
1174 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  28.79 
 
 
1345 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.23 
 
 
783 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  29.03 
 
 
1200 aa  45.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  22.94 
 
 
1392 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  31.03 
 
 
1475 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  24.05 
 
 
1190 aa  45.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 
959 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.41 
 
 
845 aa  45.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  22.03 
 
 
431 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  32.91 
 
 
299 aa  45.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.34 
 
 
1067 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  25.21 
 
 
138 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  21.48 
 
 
949 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  25.72 
 
 
965 aa  44.3  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>