21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2673 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3431  Ycf66 family protein  95.74 
 
 
372 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2673  Ycf66 family protein  100 
 
 
372 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4866  Ycf66 family protein  35.75 
 
 
365 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1276  Ycf66 family protein  64.84 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0481  Ycf66 family protein  56.36 
 
 
443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3901  hypothetical protein  57.61 
 
 
382 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2526  hypothetical protein  59.34 
 
 
251 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.766942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2438  CheA signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149631  normal  0.0919681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2650  Ycf66 family protein  35.29 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.093415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3467  Ycf66 family protein  35.29 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0519  Ycf66-like  34.57 
 
 
301 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0370943  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0055  Ycf66 family protein  34.57 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4014  Ycf66 family protein  32.94 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00711  hypothetical protein  31.25 
 
 
328 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0065  hypothetical protein  32.1 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00721  hypothetical protein  32.1 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00751  hypothetical protein  32.1 
 
 
309 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00741  hypothetical protein  30.86 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03191  hypothetical protein  32.91 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.997762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1483  Ycf66 family protein  32.53 
 
 
279 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1426  hypothetical protein  32.1 
 
 
320 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>