More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2570 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 967 aa  1977    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 967 aa  1977    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  64.65 
 
 		 667 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  64.65 
 
 		 670 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  61.05 
 
 		 817 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  61.05 
 
 		 817 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  79.01 
 
 		 251 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  35.98 
 
 		 730 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  63.07 
 
 		 705 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  62.93 
 
 		 682 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 		 937 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  64.96 
 
 		 393 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  64.96 
 
 		 393 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  61.02 
 
 		 378 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  50.46 
 
 		 840 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  35.89 
 
 		 1119 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 912 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1058 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 674 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  44.41 
 
 		 663 aa  274  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 790 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  48.57 
 
 		 786 aa  273  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  37.91 
 
 		 872 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  45 
 
 		 785 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  41.94 
 
 		 786 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  48.38 
 
 		 521 aa  266  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 		 1133 aa  263  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  43.3 
 
 		 354 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 816 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.26 
 
 		 1207 aa  259  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  35.17 
 
 		 608 aa  250  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  35.17 
 
 		 608 aa  250  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 1026 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 945 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1078 aa  237  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 		 1130 aa  237  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 1051 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 935 aa  232  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 913 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 		 608 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 642 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 642 aa  199  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  32.3 
 
 		 637 aa  199  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  30.02 
 
 		 649 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  57.24 
 
 		 591 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1114  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.81 
 
 		 722 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 		 533 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.15 
 
 		 1303 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.26 
 
 		 637 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.32 
 
 		 430 aa  176  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0539  sensory box, GGDEF family protein  51.68 
 
 		 567 aa  174  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0539  sensory box, GGDEF family protein  51.68 
 
 		 567 aa  174  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0683  sensory box/GGDEF family protein  51.68 
 
 		 567 aa  174  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00619208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0696  sensory box/GGDEF family protein  51.68 
 
 		 568 aa  174  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.612215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0757  sensory box/GGDEF family protein  51.01 
 
 		 567 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.68 
 
 		 567 aa  171  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0595  sensory box/GGDEF family protein  51.01 
 
 		 567 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0628  sensory box/GGDEF family protein  51.01 
 
 		 567 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.64 
 
 		 1245 aa  168  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4673  sensory box/GGDEF family protein  49.66 
 
 		 567 aa  168  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.6834899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0664  sensory box/GGDEF family protein  48.99 
 
 		 567 aa  167  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 1033 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1083  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.37 
 
 		 812 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1041 aa  164  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  38.04 
 
 		 658 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  51.32 
 
 		 1177 aa  161  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 1207 aa  161  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.2 
 
 		 1202 aa  159  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52 
 
 		 916 aa  158  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.41 
 
 		 1480 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  28.41 
 
 		 482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.03 
 
 		 1468 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1560 aa  144  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 		 1118 aa  140  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  26.79 
 
 		 491 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 618 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1889  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.33 
 
 		 562 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.969395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  26.05 
 
 		 853 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.52 
 
 		 568 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2258  sensory box protein  47.5 
 
 		 562 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202787  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  47.5 
 
 		 562 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629722  normal  0.285223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  26.16 
 
 		 684 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1313 aa  128  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 		 1207 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001909  GGDEF family protein  24.06 
 
 		 848 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1079 aa  125  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 1101 aa  124  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 1568 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  42.97 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00583  cyclic diguanylate phosphodiesterase  24.9 
 
 		 848 aa  122  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  46.15 
 
 		 2035 aa  120  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  25.7 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.66 
 
 		 1061 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 773 aa  118  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 		 773 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4387  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.64 
 
 		 718 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4925  sensory box sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 614 aa  116  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 		 901 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1046  putative PAS/PAC sensor protein  38.62 
 
 		 530 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>