270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2412 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  99.51 
 
 
206 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  44.83 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  40.89 
 
 
205 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  44.83 
 
 
261 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  44.83 
 
 
208 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2509  HhH-GPD family protein  43.84 
 
 
349 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00962302  hitchhiker  0.00345677 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0979  HhH-GPD family protein  45.37 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1627  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  43.84 
 
 
281 aa  188  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.312409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.63 
 
 
217 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  40.8 
 
 
216 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  42.36 
 
 
234 aa  182  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  43.15 
 
 
291 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  43.15 
 
 
290 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  43.22 
 
 
312 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.22 
 
 
312 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.22 
 
 
312 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.22 
 
 
295 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  43.22 
 
 
312 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  43.22 
 
 
312 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.22 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3089  HhH-GPD family protein  39.9 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  39.41 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0859  HhH-GPD family protein  44.39 
 
 
218 aa  178  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  42.71 
 
 
312 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1009  HhH-GPD family protein  42.64 
 
 
290 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  42.64 
 
 
287 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.13 
 
 
275 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.13 
 
 
275 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.13 
 
 
275 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  37.07 
 
 
219 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  42.13 
 
 
287 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1204  HhH-GPD family protein  41.62 
 
 
293 aa  174  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  41.62 
 
 
275 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1389  HhH-GPD family protein  41.29 
 
 
340 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.0527923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  39.39 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1624  HhH-GPD family protein  37.38 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2090  HhH-GPD family protein  37.38 
 
 
219 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1671  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 
216 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  37.44 
 
 
269 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.21 
 
 
199 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3118  HhH-GPD family protein  39.43 
 
 
209 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  41.62 
 
 
196 aa  141  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  37.7 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.07 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  41.67 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  43.95 
 
 
210 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0739  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.79 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.36 
 
 
218 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.16 
 
 
208 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.1 
 
 
163 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.16 
 
 
207 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.68 
 
 
216 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  34.81 
 
 
202 aa  121  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.52 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.32 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.55 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4930  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.82 
 
 
214 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.59 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3244  HhH-GPD family protein  34.72 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.68 
 
 
216 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.05 
 
 
220 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  36.67 
 
 
217 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  39.26 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  35.08 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  36.18 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.34 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  35.33 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  36.25 
 
 
368 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  36.36 
 
 
212 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37.13 
 
 
224 aa  111  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  33.15 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4117  HhH-GPD family protein  36.04 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.288029  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  35.11 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.91 
 
 
288 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.06 
 
 
251 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10470  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  34.55 
 
 
234 aa  108  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  34.83 
 
 
226 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0495  HhH-GPD family protein  38.12 
 
 
231 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.65814  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1159  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 
235 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000451555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3366  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.29 
 
 
221 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04389  DNA-3-methyladenine glycosylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06800)  29.7 
 
 
391 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.91 
 
 
288 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.86 
 
 
224 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 
209 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2269  HhH-GPD family protein  33.51 
 
 
207 aa  104  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309984  normal  0.119846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  34.54 
 
 
206 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.77 
 
 
209 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.25 
 
 
301 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  36.88 
 
 
216 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3124  HhH-GPD family protein  34.92 
 
 
249 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3847  HhH-GPD family protein  33.76 
 
 
214 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583366  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.93 
 
 
225 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  32.64 
 
 
209 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  32.48 
 
 
232 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  33.12 
 
 
219 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  37.5 
 
 
210 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0547  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.76 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1846  HhH-GPD family protein  30.32 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  31.85 
 
 
214 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>