101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2328 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 586 aa  1187    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  65.49 
 
 		 581 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  99.83 
 
 		 586 aa  1184    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  65.49 
 
 		 581 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  47.45 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  46.64 
 
 		 593 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  42.81 
 
 		 551 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  39.29 
 
 		 550 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  38.06 
 
 		 581 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  41.62 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  39.26 
 
 		 666 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  39.26 
 
 		 666 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  37.72 
 
 		 542 aa  334  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  40.76 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.44 
 
 		 572 aa  330  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  45.32 
 
 		 645 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  45.08 
 
 		 632 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  35.18 
 
 		 641 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  36.41 
 
 		 574 aa  313  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  36.57 
 
 		 639 aa  297  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  34.74 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  35.37 
 
 		 589 aa  289  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  36.25 
 
 		 529 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  36.22 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  35.12 
 
 		 533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  34.9 
 
 		 531 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  34.96 
 
 		 561 aa  281  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  34.97 
 
 		 563 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  35.23 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  34.34 
 
 		 624 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  34.77 
 
 		 622 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  34.5 
 
 		 604 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  33.22 
 
 		 548 aa  243  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  32.49 
 
 		 571 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  33.27 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  31.15 
 
 		 508 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  32.22 
 
 		 531 aa  227  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  32.66 
 
 		 543 aa  225  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  32.87 
 
 		 643 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  28.64 
 
 		 600 aa  211  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  31.24 
 
 		 606 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  31.65 
 
 		 510 aa  190  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  30.24 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  30.87 
 
 		 543 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  30.43 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  31.29 
 
 		 500 aa  176  8e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  30.09 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  32.98 
 
 		 561 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  42.13 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  29.53 
 
 		 531 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  46.91 
 
 		 629 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  30.23 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  46.29 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  39.85 
 
 		 555 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  30.64 
 
 		 528 aa  160  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  27.38 
 
 		 518 aa  151  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  27.8 
 
 		 568 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  47.5 
 
 		 188 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  39.15 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  52.17 
 
 		 262 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  52.17 
 
 		 262 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  66.67 
 
 		 261 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  27.92 
 
 		 515 aa  90.5  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  27.76 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  27.04 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  39.39 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  38.1 
 
 		 946 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.44 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.51 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36.11 
 
 		 932 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  27.8 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  34.04 
 
 		 255 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.61 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  35.24 
 
 		 919 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  33.05 
 
 		 186 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  24.45 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  25.41 
 
 		 784 aa  54.3  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.17 
 
 		 673 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  28.69 
 
 		 361 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  25.34 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  36.67 
 
 		 343 aa  50.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  45 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  36.73 
 
 		 424 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  31.91 
 
 		 1036 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  25.21 
 
 		 384 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.81 
 
 		 330 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  44.44 
 
 		 1821 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  32.81 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  30.58 
 
 		 694 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  40.74 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  40.74 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  48.98 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  35.85 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  27.52 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  26.52 
 
 		 335 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 		 558 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  39.13 
 
 		 468 aa  44.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.85 
 
 		 390 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  40.74 
 
 		 548 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  24.71 
 
 		 431 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>