More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2309 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
483 aa  999    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  70.27 
 
 
481 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  64.66 
 
 
481 aa  641    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  68.4 
 
 
481 aa  701    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  97.3 
 
 
483 aa  962    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  75.36 
 
 
481 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  64.79 
 
 
881 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  66.8 
 
 
482 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
476 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 
477 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
492 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 
477 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
476 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
493 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
479 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
476 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
488 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
477 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
490 aa  388  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
494 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
485 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
485 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
491 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
486 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
488 aa  359  5e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
479 aa  358  8e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
472 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
501 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
466 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
466 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
466 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
480 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
490 aa  347  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
484 aa  345  8.999999999999999e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
470 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
471 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
468 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
469 aa  342  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
469 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
478 aa  341  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
467 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
491 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
488 aa  340  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
467 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
471 aa  339  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
468 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  39.43 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
470 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
485 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
485 aa  335  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
485 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
485 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
485 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
485 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
485 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
466 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
470 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
491 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
471 aa  335  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
469 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
471 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
468 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
464 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
471 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
491 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
465 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
484 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
484 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
498 aa  332  7.000000000000001e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
483 aa  332  7.000000000000001e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
485 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
463 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
471 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
471 aa  331  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
472 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
471 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
467 aa  330  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>