20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2171 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  98.41 
 
 
314 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
314 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.2 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48742  predicted protein  24.7 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526159  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.54 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.28 
 
 
287 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  31.25 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45338  predicted protein  29.13 
 
 
893 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.506696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.35 
 
 
282 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.75 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.97 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.61 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  30.1 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87319  predicted protein  22.65 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132379  decreased coverage  0.000311139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.67 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  30.43 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.3 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 
285 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.29 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>