More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2169 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  100 
 
 
155 aa  313  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  100 
 
 
155 aa  313  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  78.71 
 
 
155 aa  263  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  70.32 
 
 
155 aa  237  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  69.68 
 
 
155 aa  236  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  72.67 
 
 
157 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  71.43 
 
 
156 aa  223  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  69.39 
 
 
154 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  60.13 
 
 
158 aa  191  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  60.96 
 
 
158 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  58.5 
 
 
167 aa  186  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  60.84 
 
 
165 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  58.5 
 
 
166 aa  184  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  55.26 
 
 
164 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  55.26 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  60 
 
 
166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
158 aa  180  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
165 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  55.92 
 
 
164 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  57.53 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  56.16 
 
 
155 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
165 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  54.79 
 
 
155 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  56.49 
 
 
154 aa  166  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  54.79 
 
 
155 aa  166  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  53.38 
 
 
150 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  55.1 
 
 
153 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
165 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  53.9 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  54.11 
 
 
154 aa  164  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  54 
 
 
155 aa  164  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  55.94 
 
 
154 aa  164  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  53.33 
 
 
161 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  55.17 
 
 
152 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  52.6 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  53.29 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  54.11 
 
 
153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  54.25 
 
 
158 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
155 aa  161  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  56.93 
 
 
161 aa  161  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  53.9 
 
 
157 aa  161  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  52.74 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  53.47 
 
 
154 aa  160  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  54.17 
 
 
168 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  54.17 
 
 
168 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  52.74 
 
 
172 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  54.17 
 
 
160 aa  159  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  53.79 
 
 
157 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  54.17 
 
 
168 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
160 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  48.39 
 
 
154 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
157 aa  158  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  51.03 
 
 
160 aa  158  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
150 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.38 
 
 
150 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
165 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
177 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  53.79 
 
 
151 aa  158  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1532  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1303  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2558  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  53.02 
 
 
157 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2032  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2467  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.838466  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2412  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
165 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  53.69 
 
 
156 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  53.69 
 
 
156 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  54.79 
 
 
151 aa  157  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
151 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5309  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0732663  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
156 aa  156  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  54.9 
 
 
154 aa  156  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
159 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
172 aa  155  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
155 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
155 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
159 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  55.17 
 
 
151 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
182 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  53.52 
 
 
167 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2049  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
148 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
157 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2032  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
148 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.148914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  53.06 
 
 
150 aa  154  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  49.67 
 
 
159 aa  154  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  51.75 
 
 
159 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2005  SsrA-binding protein  50.67 
 
 
158 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.141035 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2019  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
148 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6078  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
148 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  50.66 
 
 
155 aa  154  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1999  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
148 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1277  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.622701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  56.82 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  52.45 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  52.78 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>