More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2156 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
552 aa  1138    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  71.85 
 
 
546 aa  787    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  99.82 
 
 
552 aa  1136    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  46.24 
 
 
557 aa  511  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  46.27 
 
 
550 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  44.51 
 
 
547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.52 
 
 
545 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  40 
 
 
561 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  40.18 
 
 
561 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  40.36 
 
 
558 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  41.8 
 
 
549 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  40 
 
 
561 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  40 
 
 
558 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  40 
 
 
561 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  39.64 
 
 
558 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  40 
 
 
561 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  38.53 
 
 
541 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  36.12 
 
 
568 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  34.65 
 
 
549 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  36.28 
 
 
542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  37.52 
 
 
559 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  37.52 
 
 
559 aa  332  8e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.14 
 
 
562 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.59 
 
 
546 aa  330  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.59 
 
 
546 aa  330  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  34.77 
 
 
555 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  35.57 
 
 
560 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  34.22 
 
 
570 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  34.84 
 
 
575 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.99 
 
 
572 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.46 
 
 
547 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  34.54 
 
 
580 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.06 
 
 
558 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.81 
 
 
553 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.35 
 
 
551 aa  306  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  33.63 
 
 
556 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.27 
 
 
552 aa  299  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.37 
 
 
561 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.82 
 
 
553 aa  296  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  32.42 
 
 
596 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  33.21 
 
 
556 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  32.04 
 
 
550 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  32.04 
 
 
550 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  31.68 
 
 
550 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  31.86 
 
 
550 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.79 
 
 
576 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  32.44 
 
 
540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  32.6 
 
 
543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  31.58 
 
 
542 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.56 
 
 
586 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.2 
 
 
554 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.25 
 
 
558 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  33.87 
 
 
553 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  32.92 
 
 
543 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.97 
 
 
543 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  32.9 
 
 
545 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  30 
 
 
555 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  29.34 
 
 
713 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.87 
 
 
572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  29.31 
 
 
572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  27.42 
 
 
623 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  35.47 
 
 
274 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.75 
 
 
557 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.62 
 
 
554 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.9 
 
 
535 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  24.65 
 
 
578 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1613  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.09 
 
 
558 aa  156  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.81 
 
 
633 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.33 
 
 
563 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.14 
 
 
562 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  26.09 
 
 
567 aa  153  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2279  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.77 
 
 
635 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  26.29 
 
 
549 aa  152  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 
623 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  25.47 
 
 
581 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.03 
 
 
557 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  25.51 
 
 
620 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.78 
 
 
565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.57 
 
 
562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.97 
 
 
620 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  23.74 
 
 
585 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.8 
 
 
581 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.69 
 
 
570 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  24.9 
 
 
583 aa  146  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.4 
 
 
581 aa  146  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.37 
 
 
552 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  28.02 
 
 
547 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.99 
 
 
597 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.1 
 
 
561 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 
569 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.93 
 
 
557 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.14 
 
 
625 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0587  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.59 
 
 
531 aa  145  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0776726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  24.33 
 
 
555 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  27.81 
 
 
547 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  27.81 
 
 
547 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  27.81 
 
 
547 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.72 
 
 
618 aa  144  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.12 
 
 
555 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  27.56 
 
 
535 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>