More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2147 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  68.29 
 
 
486 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  100 
 
 
471 aa  983    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  99.79 
 
 
471 aa  981    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  69.33 
 
 
477 aa  679    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  63.17 
 
 
471 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  59.79 
 
 
490 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  38.26 
 
 
444 aa  313  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  37.97 
 
 
428 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 
448 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  39.42 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  36.17 
 
 
439 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  34.79 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  36.62 
 
 
441 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  37.4 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 
449 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  35.94 
 
 
426 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  35.34 
 
 
428 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  34.11 
 
 
434 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 
446 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 
477 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 
444 aa  213  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 
433 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 
459 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.11 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.11 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 
422 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 
469 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 
468 aa  176  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  30 
 
 
444 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.02 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 
475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.38 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
480 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 
444 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.5 
 
 
478 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.05 
 
 
461 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 
472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 
470 aa  166  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.05 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
477 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 
476 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 
509 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.72 
 
 
471 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 
501 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 
483 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
474 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  28.37 
 
 
533 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 
522 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
504 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 
504 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  30.16 
 
 
504 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
527 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 
448 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
465 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
502 aa  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  28.12 
 
 
532 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
520 aa  146  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 
498 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 
498 aa  143  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 
512 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.07 
 
 
466 aa  143  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.09 
 
 
522 aa  143  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
533 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  27.58 
 
 
529 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 
600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 
468 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 
490 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  28.16 
 
 
503 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
527 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 
468 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  27.05 
 
 
529 aa  136  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 
523 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 
451 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  27.89 
 
 
503 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  25.92 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.73 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  28.31 
 
 
591 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 
525 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  25.92 
 
 
450 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
502 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  24.94 
 
 
495 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.78 
 
 
609 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>