143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2030 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  50.59 
 
 
246 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  34.17 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  34.58 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.05 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  30.83 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  31.73 
 
 
226 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  30.86 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  30.42 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  30.42 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  30.42 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  30.42 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  33.6 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  30.38 
 
 
233 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  30.38 
 
 
233 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  30.38 
 
 
233 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  29.17 
 
 
235 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  32.24 
 
 
221 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  32.24 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  30.21 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  33.33 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  30.71 
 
 
239 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  33.33 
 
 
229 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  32.07 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  29.88 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  32.65 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  29.17 
 
 
238 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  31.47 
 
 
229 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  34.64 
 
 
201 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  34.64 
 
 
201 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  26.83 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  28.48 
 
 
302 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  28.48 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  28.48 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  28.48 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  28.48 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  27.88 
 
 
302 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  27.88 
 
 
302 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  27.88 
 
 
302 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  28.48 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  27.15 
 
 
152 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  26.11 
 
 
183 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  26.11 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  25.81 
 
 
158 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  26.09 
 
 
167 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  42.42 
 
 
159 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  24.53 
 
 
163 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  25.48 
 
 
155 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1571  CheW-like domain-containing protein  27.1 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.603726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  24.53 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  27.67 
 
 
161 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  23.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  23.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  25.16 
 
 
155 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  27.39 
 
 
192 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  23.12 
 
 
152 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  23.87 
 
 
167 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  25.33 
 
 
161 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  26.28 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  23.12 
 
 
159 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.43 
 
 
164 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.15 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.15 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  26.98 
 
 
179 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  25.87 
 
 
158 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  23.17 
 
 
154 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  23.17 
 
 
156 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  23.45 
 
 
164 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  23.17 
 
 
156 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  25.69 
 
 
158 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  24.7 
 
 
159 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  38.57 
 
 
177 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  35 
 
 
178 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  25.17 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  23.45 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  24.28 
 
 
531 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  23.45 
 
 
518 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  35 
 
 
178 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  22.56 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  23.23 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  29.14 
 
 
907 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  25.99 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  29.41 
 
 
169 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  23.87 
 
 
163 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  26.38 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  26.09 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.44 
 
 
165 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  26.19 
 
 
179 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  23.73 
 
 
154 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  22.86 
 
 
157 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  26.19 
 
 
179 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  21.85 
 
 
140 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  24.44 
 
 
164 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  31.18 
 
 
189 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  25 
 
 
159 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  22.42 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  22.62 
 
 
159 aa  45.4  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  22.29 
 
 
189 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>