43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1893 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  100 
 
 
163 aa  327  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  100 
 
 
163 aa  327  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  77.16 
 
 
163 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  61.54 
 
 
168 aa  191  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  58.02 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  53.94 
 
 
165 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  55.35 
 
 
249 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  58.9 
 
 
163 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  55.83 
 
 
163 aa  146  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  42.42 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  43.03 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  35.8 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  38.22 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  38.22 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  44.3 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  44.3 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  44.24 
 
 
202 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  44.24 
 
 
232 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  42.77 
 
 
160 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  43.95 
 
 
172 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  40.74 
 
 
173 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  47.33 
 
 
173 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  35.9 
 
 
168 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  41.4 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  40.36 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  43.87 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  42.31 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  40.85 
 
 
179 aa  97.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  38.79 
 
 
206 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  34.62 
 
 
301 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  40.61 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  38.61 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  39.74 
 
 
187 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  44.27 
 
 
193 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  39.49 
 
 
172 aa  87.8  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  34.39 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  37.43 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  42.77 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  34.38 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  34.78 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  40.96 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  39.38 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>