36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1791 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  100 
 
 
156 aa  319  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  99.36 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  66.04 
 
 
159 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  67.38 
 
 
158 aa  208  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  62.66 
 
 
158 aa  207  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  60 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  58.33 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  58.99 
 
 
156 aa  184  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  42.48 
 
 
154 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  46.43 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  44.87 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  45.32 
 
 
154 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  43.26 
 
 
169 aa  137  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  43.66 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  43.66 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  46.15 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  41.29 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  43.23 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  38.31 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  41.67 
 
 
147 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  38.82 
 
 
159 aa  124  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  40 
 
 
156 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  40.71 
 
 
165 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  41.3 
 
 
153 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  37.66 
 
 
156 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  38.41 
 
 
170 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  38.06 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  39.29 
 
 
160 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  36.77 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  39.29 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  39.29 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  38.69 
 
 
154 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>