230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1753 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  70.1 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  68.89 
 
 		 99 aa  127  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  72.04 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  69.15 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  63.44 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  65.56 
 
 		 98 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  58.06 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  55.91 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  53.12 
 
 		 97 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  55.43 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  54.17 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  54.84 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  53.76 
 
 		 98 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  53.76 
 
 		 98 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  51.04 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  52.75 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.05 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  43.3 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  34.02 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  40.62 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  42.17 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.62 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  38.14 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  41.3 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  36.84 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  41.67 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  41.18 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  43.62 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  43.62 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  35.05 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  35.42 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  38.95 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  36.08 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  35.42 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  38.64 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  37.37 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  40.91 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  35.11 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  37.78 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>