More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1684 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
119 aa  245  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  99.12 
 
 
115 aa  233  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  66.36 
 
 
107 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  60 
 
 
114 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  60 
 
 
114 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  58.95 
 
 
114 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  58.95 
 
 
114 aa  120  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  58.95 
 
 
114 aa  120  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
126 aa  120  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  56.84 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  56.84 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  57.89 
 
 
114 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  57.89 
 
 
114 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  55.79 
 
 
114 aa  117  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 
134 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  55.79 
 
 
113 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  55.79 
 
 
113 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  55.79 
 
 
113 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  56.84 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  56.84 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  56.84 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  56.84 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  56.84 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  56.84 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  56.84 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  47.79 
 
 
155 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  52.48 
 
 
115 aa  111  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  49.52 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
120 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  48.45 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  54.74 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  54.74 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  54.74 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  53.68 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  47.17 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  52.08 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.17 
 
 
126 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  47.17 
 
 
126 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
108 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.17 
 
 
126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.17 
 
 
126 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  47.17 
 
 
126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  48.11 
 
 
121 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  45.79 
 
 
129 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 
125 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.17 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.11 
 
 
107 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  38.53 
 
 
123 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 
112 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  53 
 
 
115 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.91 
 
 
140 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  54.74 
 
 
112 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
124 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
159 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 
121 aa  103  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 
108 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
116 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  48.11 
 
 
107 aa  103  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  49.46 
 
 
121 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  42.31 
 
 
125 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 
129 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 
117 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 
115 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 
113 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
119 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
109 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.17 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 
130 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
115 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
125 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
114 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 
118 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  48.39 
 
 
154 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  50 
 
 
130 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 
149 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
107 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 
121 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  43.69 
 
 
118 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 
119 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 
129 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  51.06 
 
 
148 aa  100  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
139 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
117 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  46.94 
 
 
144 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 
144 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  46.94 
 
 
144 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>