More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1542 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  42.69 
 
 
1045 aa  783    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.23 
 
 
1037 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.81 
 
 
1039 aa  696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  38.74 
 
 
1047 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  39.2 
 
 
1023 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.57 
 
 
1039 aa  697    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  36.86 
 
 
1052 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  40.84 
 
 
1039 aa  738    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.36 
 
 
1048 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.61 
 
 
1039 aa  696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  39.03 
 
 
1039 aa  688    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  39.42 
 
 
1039 aa  688    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.34 
 
 
1037 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.01 
 
 
1066 aa  743    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.49 
 
 
1071 aa  763    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 
1054 aa  2109    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  38.87 
 
 
1049 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.21 
 
 
1066 aa  743    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  38.86 
 
 
1039 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.55 
 
 
1049 aa  685    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  39.77 
 
 
1036 aa  710    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  39 
 
 
1043 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  40.08 
 
 
1034 aa  714    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  41.19 
 
 
1041 aa  733    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  38.34 
 
 
1031 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  39.36 
 
 
1043 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  41.73 
 
 
1030 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  58.02 
 
 
1061 aa  1224    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.21 
 
 
1034 aa  740    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.23 
 
 
1048 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.46 
 
 
1053 aa  1788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.86 
 
 
1039 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.81 
 
 
1049 aa  680    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.98 
 
 
1026 aa  715    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  38.89 
 
 
1047 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.21 
 
 
1049 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.98 
 
 
1043 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.94 
 
 
1092 aa  732    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 
1040 aa  638    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.57 
 
 
1039 aa  697    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 
1052 aa  623  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  36.93 
 
 
1075 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  36.59 
 
 
1058 aa  621  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  36.28 
 
 
1039 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  36.14 
 
 
1032 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  36.49 
 
 
1066 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  37.08 
 
 
1058 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  35.61 
 
 
1054 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.85 
 
 
1082 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.06 
 
 
1064 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.83 
 
 
1075 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.78 
 
 
1070 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  35.59 
 
 
1076 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  33.93 
 
 
1065 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  35.13 
 
 
1069 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  36.12 
 
 
1075 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  36 
 
 
1068 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  34.8 
 
 
1076 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.69 
 
 
1070 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.91 
 
 
1070 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.89 
 
 
1077 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.89 
 
 
1077 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.89 
 
 
1077 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.81 
 
 
1068 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.21 
 
 
1077 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.14 
 
 
1066 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  36 
 
 
1068 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.38 
 
 
1062 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.78 
 
 
1070 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.89 
 
 
1077 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  33.21 
 
 
1064 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.91 
 
 
1070 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.89 
 
 
1077 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  33.4 
 
 
1069 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  33.95 
 
 
1072 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.89 
 
 
1077 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  33.88 
 
 
1070 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.91 
 
 
1070 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.91 
 
 
1070 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  34.37 
 
 
1066 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.8 
 
 
1077 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  33.91 
 
 
1029 aa  562  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.49 
 
 
1052 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.71 
 
 
1068 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.02 
 
 
1443 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  33.93 
 
 
1051 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 
1064 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  35.23 
 
 
1077 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  35.78 
 
 
1064 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.53 
 
 
1034 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  34 
 
 
1033 aa  554  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  33.56 
 
 
1032 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  33.92 
 
 
1074 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  33.02 
 
 
1075 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  33.83 
 
 
1046 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  33.97 
 
 
1046 aa  552  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
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NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.74 
 
 
1063 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
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NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  33.14 
 
 
1032 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 
1054 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  35.78 
 
 
1061 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
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