98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1445 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  98.26 
 
 
632 aa  1272    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 
645 aa  1316    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  58.85 
 
 
551 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  45.32 
 
 
586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  45.32 
 
 
586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  40.68 
 
 
581 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  40.68 
 
 
581 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  44.65 
 
 
531 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  49.3 
 
 
641 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  41.89 
 
 
591 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  41.71 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  39.4 
 
 
639 aa  274  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  44.35 
 
 
593 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  42.51 
 
 
666 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  42.51 
 
 
666 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  37.71 
 
 
581 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  30.94 
 
 
508 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  40.66 
 
 
491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  39.15 
 
 
533 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  37.44 
 
 
563 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  37.1 
 
 
572 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  38.4 
 
 
550 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  38.55 
 
 
574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  39.02 
 
 
550 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  36.93 
 
 
542 aa  236  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  37.31 
 
 
561 aa  235  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.32 
 
 
539 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  37.53 
 
 
530 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  35.36 
 
 
622 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  32.16 
 
 
600 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  33.69 
 
 
658 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33.06 
 
 
604 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  32.88 
 
 
624 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  34.22 
 
 
571 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  31.42 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  32.91 
 
 
606 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  34.86 
 
 
518 aa  181  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  28.67 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  33.72 
 
 
543 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  52.66 
 
 
531 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  33.72 
 
 
643 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  33.57 
 
 
548 aa  171  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  34.19 
 
 
510 aa  163  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  28.89 
 
 
561 aa  161  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  37.1 
 
 
513 aa  160  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  37.39 
 
 
500 aa  160  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  39.75 
 
 
524 aa  154  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  46.7 
 
 
578 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  37 
 
 
568 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  43.65 
 
 
629 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  40.85 
 
 
475 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  44.57 
 
 
555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.34 
 
 
518 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  35.44 
 
 
528 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  38.08 
 
 
543 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  35.77 
 
 
544 aa  137  9e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  43.72 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  37.87 
 
 
527 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  48.82 
 
 
188 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  69.01 
 
 
262 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  69.01 
 
 
262 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  64.71 
 
 
261 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  31.86 
 
 
515 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  30.53 
 
 
515 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  30.23 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  26.97 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.38 
 
 
449 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.37 
 
 
485 aa  64.7  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  37.11 
 
 
946 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  34.04 
 
 
255 aa  62  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  31.43 
 
 
432 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  28.08 
 
 
437 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  31.75 
 
 
415 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  31.69 
 
 
426 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  31.73 
 
 
932 aa  54.7  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  36.36 
 
 
416 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  30.95 
 
 
414 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  36.67 
 
 
343 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  32.28 
 
 
186 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  36.17 
 
 
432 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  35.59 
 
 
673 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.95 
 
 
506 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  33.78 
 
 
361 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  32.43 
 
 
784 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  42.86 
 
 
1821 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  32.23 
 
 
415 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  40.32 
 
 
575 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  32.41 
 
 
919 aa  47.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  38.89 
 
 
400 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  38.89 
 
 
400 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  27.88 
 
 
330 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  33.67 
 
 
424 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  35.85 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  37.04 
 
 
413 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  44.44 
 
 
1036 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  29.55 
 
 
1710 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  37.04 
 
 
536 aa  43.9  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  41.18 
 
 
548 aa  43.9  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>