More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1349 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1578 aa  3237    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  99.24 
 
 		 1611 aa  3213    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1068 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.63 
 
 		 1058 aa  483  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1090 aa  483  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1090 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 		 1099 aa  463  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 844 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 844 aa  460  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  48.46 
 
 		 1285 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  51.38 
 
 		 810 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 882 aa  439  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.11 
 
 		 1002 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1131 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.11 
 
 		 1002 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 		 1002 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.31 
 
 		 1322 aa  416  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  48.34 
 
 		 800 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1659 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 		 1626 aa  383  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 803 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1625 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1629 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1027 aa  377  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 1629 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1632 aa  373  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1044 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 1202 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1238 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1238 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1238 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 865 aa  358  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1193 aa  358  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1193 aa  357  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 1245 aa  356  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  33.58 
 
 		 1200 aa  355  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1238 aa  354  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  33.93 
 
 		 1236 aa  353  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1230 aa  351  8e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1234 aa  350  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.84 
 
 		 935 aa  350  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1236 aa  349  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1236 aa  349  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1236 aa  349  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  31.55 
 
 		 1417 aa  347  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 869 aa  345  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  33.73 
 
 		 1188 aa  345  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.51 
 
 		 1233 aa  343  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 1234 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 747 aa  340  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 1050 aa  338  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1236 aa  338  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  30.97 
 
 		 1418 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1426 aa  335  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1433 aa  334  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 1501 aa  328  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 1075 aa  328  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 1363 aa  328  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 1927 aa  327  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 1582 aa  326  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 865 aa  325  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 1330 aa  321  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 766 aa  320  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 939 aa  319  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1391 aa  317  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1120 aa  309  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2132  histidine kinase  39.62 
 
 		 857 aa  307  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2088  histidine kinase  39.62 
 
 		 857 aa  307  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1118 aa  305  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  30.57 
 
 		 685 aa  305  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1350 aa  305  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  34.3 
 
 		 823 aa  304  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 784 aa  303  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 1452 aa  302  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  34.55 
 
 		 802 aa  301  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 		 989 aa  299  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1362 aa  297  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 721 aa  296  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 989 aa  296  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 785 aa  294  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1158 aa  292  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  32.84 
 
 		 1028 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1039 aa  291  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 		 1204 aa  290  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1121 aa  290  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  31.04 
 
 		 1141 aa  290  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.26 
 
 		 1120 aa  289  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1407 aa  289  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 1314 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 1059 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  31.28 
 
 		 1125 aa  288  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  43.8 
 
 		 781 aa  288  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 		 1120 aa  287  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 		 1222 aa  287  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1245 aa  287  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 1258 aa  286  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1323 aa  286  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 720 aa  286  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 969 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1287 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>