25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1225 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1255  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1225  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  48.06 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4551  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1281  hypothetical protein  38.21 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.582719 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0054  hypothetical protein  44.62 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  32.54 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4788  hypothetical protein  44.07 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.175046  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 566 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3835  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  30.89 
 
 		 1141 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1972  hypothetical protein  36.84 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  33.72 
 
 		 644 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 732 aa  47.8  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3007  hypothetical protein  39.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  28.69 
 
 		 356 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1011  hypothetical protein  31.88 
 
 		 249 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.823882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  32.26 
 
 		 645 aa  44.3  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  34.41 
 
 		 1017 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 2725 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  30 
 
 		 340 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  31.91 
 
 		 642 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  30.59 
 
 		 720 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3331  hypothetical protein  33.61 
 
 		 249 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  50 
 
 		 570 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>