291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1094 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  100 
 
 
380 aa  771  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  100 
 
 
380 aa  771  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  72.44 
 
 
384 aa  540  1e-152  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  64.46 
 
 
371 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  67.37 
 
 
376 aa  466  1e-130  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  65.28 
 
 
390 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  67.11 
 
 
377 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  55.41 
 
 
387 aa  352  5e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  42.86 
 
 
352 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  37.83 
 
 
375 aa  263  5e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  37.83 
 
 
375 aa  263  5e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  37.83 
 
 
375 aa  263  5e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  37.83 
 
 
375 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  37.57 
 
 
375 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  38.06 
 
 
370 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  39.95 
 
 
374 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  37.57 
 
 
375 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  37.57 
 
 
375 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  38.06 
 
 
370 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  37.57 
 
 
375 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  37.57 
 
 
375 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  37.57 
 
 
375 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  37.3 
 
 
373 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  38.48 
 
 
371 aa  259  8e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  40.9 
 
 
348 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  40.62 
 
 
348 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  38.79 
 
 
372 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  36.41 
 
 
369 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  38.42 
 
 
374 aa  249  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  36.24 
 
 
374 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.05 
 
 
360 aa  246  5e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  42.47 
 
 
364 aa  244  2e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.56 
 
 
386 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  38.22 
 
 
374 aa  239  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.68 
 
 
373 aa  239  4e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  39.89 
 
 
366 aa  236  5e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  39.21 
 
 
375 aa  235  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  35.54 
 
 
361 aa  235  1e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  35.54 
 
 
361 aa  235  1e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  33.33 
 
 
364 aa  232  7e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.9 
 
 
372 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1935  recombination protein F  43.5 
 
 
353 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  35.17 
 
 
365 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  38.78 
 
 
369 aa  229  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.08 
 
 
364 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.82 
 
 
364 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  37.28 
 
 
371 aa  223  5e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  33.77 
 
 
365 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.21 
 
 
371 aa  216  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  35.96 
 
 
370 aa  214  2e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.36 
 
 
392 aa  213  5e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  36.99 
 
 
359 aa  212  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.53 
 
 
365 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  36.61 
 
 
378 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17601  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  36.12 
 
 
325 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  35.39 
 
 
362 aa  201  1e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  33.83 
 
 
398 aa  201  2e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.31 
 
 
370 aa  198  1e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.99 
 
 
377 aa  199  1e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.07 
 
 
397 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22781  recombination protein F  42.82 
 
 
352 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  34.39 
 
 
368 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.75 
 
 
376 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  34.92 
 
 
386 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.25 
 
 
420 aa  190  3e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.1529e-05  hitchhiker  4.44236e-07 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  34.42 
 
 
390 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
399 aa  189  6e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.07 
 
 
415 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  9.51254e-07  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.94 
 
 
369 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.68 
 
 
414 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.35 
 
 
397 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  33.52 
 
 
371 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  34.7 
 
 
380 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  33.17 
 
 
394 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.95 
 
 
398 aa  186  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 
378 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  34.7 
 
 
380 aa  185  1e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  34.7 
 
 
380 aa  185  1e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  35.77 
 
 
366 aa  184  2e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.34 
 
 
359 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17801  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  35.62 
 
 
297 aa  183  4e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.6 
 
 
363 aa  183  4e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  32.58 
 
 
420 aa  183  4e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.02 
 
 
382 aa  183  5e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.05 
 
 
391 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.88 
 
 
381 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.98 
 
 
390 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  30.53 
 
 
359 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  33.87 
 
 
386 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  34.29 
 
 
376 aa  181  3e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  31.41 
 
 
401 aa  180  5e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  33.08 
 
 
414 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  35.4 
 
 
385 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.79 
 
 
380 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1665  DNA replication and repair protein RecF  33.98 
 
 
297 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  34.07 
 
 
377 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  32.55 
 
 
399 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.7 
 
 
401 aa  176  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  32.8 
 
 
389 aa  175  1e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17641  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  36.26 
 
 
265 aa  175  1e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>