87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1061 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  99.35 
 
 
310 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  57.42 
 
 
305 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  53.85 
 
 
302 aa  355  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  56.77 
 
 
303 aa  348  8e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  57.47 
 
 
306 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  56.09 
 
 
305 aa  343  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  55.13 
 
 
303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  50.32 
 
 
304 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  54.49 
 
 
302 aa  325  5e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  47.59 
 
 
305 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  50 
 
 
297 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  46.98 
 
 
304 aa  287  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  49.67 
 
 
293 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  47.88 
 
 
302 aa  265  7e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  39.1 
 
 
310 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  38.59 
 
 
306 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  45.19 
 
 
305 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  45.19 
 
 
305 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  40.58 
 
 
312 aa  225  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  37.9 
 
 
307 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  39.81 
 
 
306 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  36.22 
 
 
311 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  35.16 
 
 
304 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  35.76 
 
 
305 aa  192  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  37.46 
 
 
296 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  35.22 
 
 
304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  35.22 
 
 
304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  35.22 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  34.71 
 
 
304 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  51.28 
 
 
128 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  29.77 
 
 
297 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  26.67 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  26.27 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.52 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  25.56 
 
 
454 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  24.26 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  26.94 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  26.94 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  35.71 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  26.54 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  28.05 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  27.99 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  33.33 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.75 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  25.86 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.6 
 
 
125 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.23 
 
 
493 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  31.45 
 
 
154 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  31.45 
 
 
154 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  31.45 
 
 
154 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.77 
 
 
271 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  28.63 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  31.16 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.11 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  23.73 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0214  Mrr restriction system protein  43.33 
 
 
70 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  28.91 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  30 
 
 
252 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  30.56 
 
 
184 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  34.38 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  29.37 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.09 
 
 
493 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  31.09 
 
 
585 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  34.65 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  30.65 
 
 
346 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  30.52 
 
 
189 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  30.37 
 
 
171 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  27.59 
 
 
345 aa  45.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  37.5 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  37.5 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  30.93 
 
 
454 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  29.03 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  27.73 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  30.09 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  26.49 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  31.07 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.77 
 
 
450 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  30.09 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  28.07 
 
 
222 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  29.9 
 
 
454 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  28.69 
 
 
374 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0984  hypothetical protein  27.62 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0760  hypothetical protein  31.25 
 
 
196 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.517474  normal  0.222841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  28.46 
 
 
447 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  29.9 
 
 
454 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  29.66 
 
 
351 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>