More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0832 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  70.23 
 
 		 540 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  61.84 
 
 		 505 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  69.56 
 
 		 539 aa  764    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  70.48 
 
 		 546 aa  769    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  84.53 
 
 		 531 aa  909    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  70.23 
 
 		 540 aa  740    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  70.8 
 
 		 540 aa  756    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  61.64 
 
 		 505 aa  640    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  69.71 
 
 		 546 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  82.75 
 
 		 540 aa  873    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  69.56 
 
 		 539 aa  764    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 536 aa  1100    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  82.47 
 
 		 541 aa  875    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  81.57 
 
 		 541 aa  890    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  70.93 
 
 		 536 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  62.04 
 
 		 505 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 536 aa  1100    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  82.23 
 
 		 530 aa  886    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  87.43 
 
 		 536 aa  951    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  70.1 
 
 		 546 aa  749    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  70.19 
 
 		 546 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  58.07 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  57.51 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  56.67 
 
 		 568 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  57.22 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  55.68 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  59.14 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  56.75 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 508 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  56.75 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  56.87 
 
 		 532 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  55.27 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  55.53 
 
 		 520 aa  556  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  56.67 
 
 		 517 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  56.47 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  55.02 
 
 		 514 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  56.39 
 
 		 519 aa  549  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 515 aa  548  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  55.1 
 
 		 521 aa  546  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  55.06 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  56.16 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  55.95 
 
 		 511 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  54.72 
 
 		 507 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  55.36 
 
 		 516 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  55.92 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 516 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  55.77 
 
 		 518 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 522 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  55.06 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44618  2-isopropylmalate synthase  53.39 
 
 		 663 aa  534  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  51.64 
 
 		 522 aa  535  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  54.05 
 
 		 512 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  53.77 
 
 		 510 aa  529  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  51.35 
 
 		 515 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  53.52 
 
 		 518 aa  529  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  55.17 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  54.13 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  54.75 
 
 		 513 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 515 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  55.17 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 514 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 514 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  50.47 
 
 		 524 aa  528  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  54.26 
 
 		 516 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 514 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  53.36 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 512 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  54.01 
 
 		 519 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  53.11 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  55.92 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  54.73 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  53.14 
 
 		 528 aa  524  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  52.83 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  52.91 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 515 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  54.73 
 
 		 513 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 503 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  51.35 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  52.9 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  52.7 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  52.92 
 
 		 624 aa  520  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  51.64 
 
 		 523 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  53.67 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  52.22 
 
 		 527 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  53.23 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  52.61 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  52.22 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>