96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0626 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  100 
 
 
439 aa  909    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  38.69 
 
 
427 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  31.78 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  33.06 
 
 
454 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  30.86 
 
 
442 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  31.34 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  29.95 
 
 
422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  30.68 
 
 
421 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  50.88 
 
 
478 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  28.98 
 
 
403 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  29.18 
 
 
406 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  29.41 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  27.75 
 
 
455 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  27.04 
 
 
452 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.55 
 
 
430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  29.28 
 
 
423 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  28 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  28.61 
 
 
422 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  34.09 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  29.39 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  26.97 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  27.94 
 
 
464 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  36.42 
 
 
482 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  52.75 
 
 
203 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  39.06 
 
 
415 aa  93.2  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  38.75 
 
 
709 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  41.58 
 
 
769 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  37.93 
 
 
736 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  43.18 
 
 
464 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  36.75 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  37.17 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  29.55 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  37.72 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  32.54 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  37.5 
 
 
577 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  34.92 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.52 
 
 
429 aa  59.7  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  28.03 
 
 
608 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  21.29 
 
 
513 aa  54.3  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  45 
 
 
582 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  39.24 
 
 
610 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  23.92 
 
 
346 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.14 
 
 
666 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.83 
 
 
642 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  22.62 
 
 
600 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  27.01 
 
 
457 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  37.88 
 
 
562 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  31.37 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  38.36 
 
 
712 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.88 
 
 
647 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  20.89 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  35 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  27.27 
 
 
532 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  47.92 
 
 
604 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  26.92 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.19 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  35.62 
 
 
79 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  33.33 
 
 
352 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  39.47 
 
 
619 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  46 
 
 
666 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  32.61 
 
 
670 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  39.44 
 
 
359 aa  47.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  30.17 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  41.3 
 
 
458 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  24 
 
 
588 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.44 
 
 
634 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.97 
 
 
607 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  24.31 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.47 
 
 
548 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  55.26 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  26.97 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  27.17 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  38.89 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  35.53 
 
 
447 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  25.66 
 
 
461 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  32.18 
 
 
581 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  29.25 
 
 
804 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  40.91 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  43.55 
 
 
708 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  41.67 
 
 
641 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  38.89 
 
 
544 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  42.55 
 
 
554 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 
376 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  27.5 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  31.52 
 
 
657 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  40 
 
 
496 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  26.28 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.96 
 
 
614 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  22.89 
 
 
409 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.51 
 
 
605 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  40 
 
 
653 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  43.14 
 
 
874 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  43.14 
 
 
874 aa  43.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  36.07 
 
 
586 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>