More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0607 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  53.09 
 
 
963 aa  1005    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  52.01 
 
 
956 aa  962    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
971 aa  1977    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  59.38 
 
 
975 aa  1112    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  52.78 
 
 
959 aa  968    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  99.38 
 
 
971 aa  1962    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  38.22 
 
 
1097 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  27.21 
 
 
854 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  24.33 
 
 
837 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.99 
 
 
884 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  25.21 
 
 
842 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  25.21 
 
 
842 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  26.61 
 
 
907 aa  195  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.95 
 
 
840 aa  194  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.82 
 
 
891 aa  194  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.24 
 
 
889 aa  190  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  24.64 
 
 
791 aa  190  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  24.06 
 
 
874 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.61 
 
 
867 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  27.01 
 
 
890 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  25.09 
 
 
826 aa  185  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 
871 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.65 
 
 
868 aa  179  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.72 
 
 
950 aa  179  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  24.41 
 
 
842 aa  177  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  25.91 
 
 
870 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  24.46 
 
 
788 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.67 
 
 
821 aa  168  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.08 
 
 
903 aa  162  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  24.64 
 
 
886 aa  162  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  24.33 
 
 
868 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.46 
 
 
797 aa  158  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  24.21 
 
 
725 aa  158  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  23.72 
 
 
708 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  28.29 
 
 
865 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  25.28 
 
 
1240 aa  130  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  35.79 
 
 
866 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  25.73 
 
 
891 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.12 
 
 
887 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  33.68 
 
 
868 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  33.68 
 
 
868 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.85 
 
 
873 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  35.39 
 
 
868 aa  122  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  34.21 
 
 
868 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  27.83 
 
 
869 aa  121  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  28.12 
 
 
868 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  32.32 
 
 
868 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  27.42 
 
 
906 aa  117  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  33.68 
 
 
868 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  25.92 
 
 
869 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.66 
 
 
887 aa  110  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  47.01 
 
 
414 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.17 
 
 
811 aa  108  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  23.13 
 
 
558 aa  108  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  31.82 
 
 
275 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  32.06 
 
 
386 aa  103  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  30.66 
 
 
871 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.37 
 
 
389 aa  102  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  29.3 
 
 
892 aa  102  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.01 
 
 
852 aa  101  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  29.44 
 
 
594 aa  101  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  22.36 
 
 
592 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  35 
 
 
835 aa  100  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  33.52 
 
 
825 aa  99.4  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  33.33 
 
 
359 aa  98.2  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  46 
 
 
434 aa  97.8  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  36.16 
 
 
971 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  30 
 
 
602 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.59 
 
 
386 aa  96.3  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.54 
 
 
902 aa  96.3  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.07 
 
 
869 aa  96.3  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.69 
 
 
408 aa  95.5  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  44.55 
 
 
760 aa  93.6  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  24.6 
 
 
537 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  31.08 
 
 
885 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  27.89 
 
 
885 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  34.8 
 
 
765 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.01 
 
 
835 aa  91.3  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  34.78 
 
 
726 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  29.41 
 
 
610 aa  90.5  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  36.84 
 
 
312 aa  89.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  31.7 
 
 
781 aa  90.1  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  30.8 
 
 
758 aa  90.1  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  29.7 
 
 
609 aa  89.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.95 
 
 
758 aa  89.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  30.99 
 
 
758 aa  89  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 
792 aa  88.2  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 
757 aa  88.2  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  41 
 
 
586 aa  88.2  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 
792 aa  88.2  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 
792 aa  88.2  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 
792 aa  88.2  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 
792 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.23 
 
 
769 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 
792 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 
792 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 
792 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 
792 aa  87  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  23 
 
 
560 aa  87  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  30.94 
 
 
792 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>