37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0472 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  100 
 
 
369 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  66.22 
 
 
368 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  34.3 
 
 
352 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  33.42 
 
 
353 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  23.26 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  22.98 
 
 
452 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  32.97 
 
 
449 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  32.65 
 
 
455 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  24.1 
 
 
445 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  28 
 
 
482 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  33.72 
 
 
203 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  24.32 
 
 
464 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  31.4 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  24.79 
 
 
769 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  23 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  31.33 
 
 
736 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  28.99 
 
 
403 aa  49.3  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  22.81 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  34.31 
 
 
577 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  31.4 
 
 
423 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  28.26 
 
 
440 aa  47  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 
406 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  26.7 
 
 
418 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  55.26 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  24.26 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  32.1 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 
709 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  41.67 
 
 
454 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  27.68 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  20.31 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  36 
 
 
490 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  29 
 
 
520 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  28.04 
 
 
459 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  33.33 
 
 
456 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  24.74 
 
 
522 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  44 
 
 
409 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  33.8 
 
 
515 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>