More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0448 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  49 
 
 
759 aa  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  49 
 
 
759 aa  710    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  59.81 
 
 
752 aa  891    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  45.43 
 
 
757 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  47.35 
 
 
759 aa  657    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  48.05 
 
 
765 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  46.6 
 
 
769 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  49.53 
 
 
773 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  48.54 
 
 
781 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  46.63 
 
 
752 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  48.87 
 
 
759 aa  707    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  48.21 
 
 
756 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3143  malic enzyme  48.05 
 
 
760 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231587  normal  0.133413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  48.47 
 
 
756 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  46.87 
 
 
774 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  47.94 
 
 
756 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  50.33 
 
 
763 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  48.02 
 
 
759 aa  690    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  50.2 
 
 
766 aa  741    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  48.34 
 
 
759 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  46.04 
 
 
762 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  46.6 
 
 
769 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  48.21 
 
 
756 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  48.59 
 
 
761 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  48.21 
 
 
756 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  60.89 
 
 
749 aa  879    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  44.99 
 
 
779 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  47.08 
 
 
759 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  47.36 
 
 
758 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  47.83 
 
 
777 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2754  malic enzyme  46.74 
 
 
780 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223736  normal  0.851039 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  46.69 
 
 
763 aa  662    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  46.6 
 
 
769 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0498  malic enzyme  46.12 
 
 
775 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423253  normal  0.484498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  48.21 
 
 
773 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  46.6 
 
 
769 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  46.6 
 
 
771 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  55.09 
 
 
783 aa  810    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  60.81 
 
 
752 aa  877    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  45.55 
 
 
759 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  46.36 
 
 
779 aa  656    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  48.34 
 
 
756 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  46.6 
 
 
785 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  47.27 
 
 
782 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  59.15 
 
 
752 aa  889    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  45.55 
 
 
751 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  46.6 
 
 
769 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  49.66 
 
 
769 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  46.96 
 
 
760 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  46.99 
 
 
753 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  46.87 
 
 
768 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  48.47 
 
 
756 aa  695    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  55.85 
 
 
771 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  54.64 
 
 
773 aa  805    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  49.93 
 
 
754 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  46.38 
 
 
769 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  46.57 
 
 
758 aa  665    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  45.16 
 
 
754 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  47 
 
 
774 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  47.93 
 
 
769 aa  667    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  47.01 
 
 
771 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  49 
 
 
759 aa  708    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  47.86 
 
 
767 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  47.61 
 
 
759 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  47.87 
 
 
760 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  46.34 
 
 
779 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  46.28 
 
 
772 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  47.52 
 
 
764 aa  699    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  47.61 
 
 
759 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  48.21 
 
 
756 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  49 
 
 
759 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  45.27 
 
 
777 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  48.25 
 
 
773 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  50.07 
 
 
764 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  49 
 
 
759 aa  710    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  47.47 
 
 
759 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  48.99 
 
 
754 aa  682    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  46.6 
 
 
785 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  47.94 
 
 
756 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  46.95 
 
 
773 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  47.18 
 
 
754 aa  682    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  46.97 
 
 
770 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  47.79 
 
 
761 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  54.61 
 
 
757 aa  805    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  47.08 
 
 
755 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  46.6 
 
 
769 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  48.21 
 
 
756 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  46.49 
 
 
776 aa  694    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  48.21 
 
 
756 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  46.66 
 
 
766 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  46.6 
 
 
761 aa  658    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  48.38 
 
 
756 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  46.47 
 
 
766 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  47.4 
 
 
766 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  48.97 
 
 
753 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  47.94 
 
 
756 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  46.6 
 
 
785 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  47.8 
 
 
766 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  58.06 
 
 
757 aa  847    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  48.21 
 
 
756 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>