More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0237 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  76.67 
 
 
120 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  70 
 
 
120 aa  182  1e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  70 
 
 
120 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 
120 aa  178  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 
122 aa  172  2e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  67.23 
 
 
122 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  65 
 
 
122 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  65.83 
 
 
122 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  65.83 
 
 
122 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  71.43 
 
 
122 aa  160  4e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  65 
 
 
122 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 
120 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 
122 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 
122 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  70 
 
 
120 aa  154  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  65.77 
 
 
125 aa  150  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  61.67 
 
 
122 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  66.06 
 
 
122 aa  148  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  61.34 
 
 
119 aa  144  4e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  61.34 
 
 
120 aa  144  4e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  63.06 
 
 
118 aa  142  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  60.5 
 
 
120 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  53.39 
 
 
118 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  63.06 
 
 
118 aa  140  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
124 aa  140  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  63.03 
 
 
120 aa  139  1e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  55.83 
 
 
122 aa  139  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 
121 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  136  8e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  136  8e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  136  8e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  136  8e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  136  8e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  136  8e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  136  8e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 
120 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  57.76 
 
 
119 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
120 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
120 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 
124 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 
121 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 
122 aa  134  3e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 
120 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  54.17 
 
 
122 aa  134  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  9.83895e-07 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 
119 aa  134  6e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  54.17 
 
 
122 aa  134  6e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  1.28953e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 
119 aa  134  6e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  55 
 
 
121 aa  133  7e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  59.17 
 
 
118 aa  133  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 
120 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  4.32903e-05  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  58.18 
 
 
122 aa  132  1e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 
120 aa  132  1e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 
120 aa  132  2e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  63.03 
 
 
122 aa  132  2e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  65.66 
 
 
113 aa  132  2e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 
122 aa  131  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
120 aa  132  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  63.03 
 
 
122 aa  132  2e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.99642e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3322  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 
117 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000880137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  53.78 
 
 
122 aa  130  4e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  55.83 
 
 
116 aa  130  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  64 
 
 
121 aa  130  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  7.37084e-06  hitchhiker  6.40833e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  55.93 
 
 
120 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
122 aa  130  7e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  56.3 
 
 
117 aa  130  8e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.24 
 
 
122 aa  130  8e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 
120 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 
120 aa  130  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  58.62 
 
 
126 aa  129  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  51.26 
 
 
122 aa  129  1e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
120 aa  129  2e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
122 aa  128  2e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 
121 aa  129  2e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  53.91 
 
 
120 aa  129  2e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  7.4744e-08 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
120 aa  128  2e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  56.9 
 
 
119 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
120 aa  127  4e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  58.33 
 
 
117 aa  127  4e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
120 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  56.03 
 
 
134 aa  126  8e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 
136 aa  126  9e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.97313e-06  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  56.48 
 
 
134 aa  125  2e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  56.25 
 
 
124 aa  125  2e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 
124 aa  125  2e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  54.31 
 
 
134 aa  125  2e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  2.55511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  56.03 
 
 
127 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
120 aa  124  4e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  55.17 
 
 
127 aa  124  4e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 
118 aa  124  4e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  58.77 
 
 
127 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  53.78 
 
 
120 aa  124  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  54.62 
 
 
123 aa  124  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  49.17 
 
 
116 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  55.83 
 
 
117 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  53.66 
 
 
121 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 
119 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>