More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0084 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  97.87 
 
 		 423 aa  862    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 423 aa  879    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  33.87 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  35.15 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  35 
 
 		 361 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  35.07 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 		 438 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  36.42 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  33.54 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  34.88 
 
 		 632 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.23 
 
 		 313 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.43 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  33.74 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.35 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  31.86 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  31.99 
 
 		 335 aa  160  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  33.24 
 
 		 468 aa  159  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  33.23 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  33.54 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  42.05 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  33.84 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.14 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  34.13 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.97 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 		 727 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 		 329 aa  150  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  32.02 
 
 		 662 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  33.05 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  33.44 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  40.59 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 		 319 aa  144  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  31.38 
 
 		 331 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.86 
 
 		 379 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 		 342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  37.14 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  34.62 
 
 		 417 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  29.55 
 
 		 327 aa  140  6e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 		 308 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.85 
 
 		 489 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  31.98 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.41 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  31.11 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  33.95 
 
 		 350 aa  134  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 		 652 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 418 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  31.6 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.52 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.89 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.93 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  30.51 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.93 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 454 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.9 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.53 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  32.27 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.97 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 		 336 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  32.25 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  35.5 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 		 325 aa  126  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 		 409 aa  126  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  31.07 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.49 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  42.26 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  31.72 
 
 		 315 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>