31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0058 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  62.7 
 
 
253 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  66.27 
 
 
253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  35.22 
 
 
248 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  36.59 
 
 
222 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  34.23 
 
 
235 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  35.27 
 
 
232 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  36.61 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  28.08 
 
 
228 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  29.02 
 
 
219 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  28.96 
 
 
215 aa  95.5  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  27.52 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  24.39 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  28.18 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  29.29 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  24.7 
 
 
272 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  27.51 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  24.89 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  28.36 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  25.68 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  25.27 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  31.01 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  27.04 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  25.68 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  22.12 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0827  hypothetical protein  54.55 
 
 
101 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0602  hypothetical protein  23 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  22.58 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  24.3 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  22.39 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>