More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0043 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  98.52 
 
 
337 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
337 aa  700    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  69.58 
 
 
332 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  66.87 
 
 
332 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  66.47 
 
 
333 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  68.67 
 
 
332 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  69.44 
 
 
329 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  64.63 
 
 
332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  64.33 
 
 
332 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  60.37 
 
 
332 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  58.39 
 
 
323 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 
328 aa  381  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  56.83 
 
 
324 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  55.62 
 
 
354 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  52.34 
 
 
333 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  53.85 
 
 
326 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  53.56 
 
 
326 aa  363  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 
329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  51.71 
 
 
331 aa  361  9e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  54.4 
 
 
320 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  53.56 
 
 
325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  51.85 
 
 
328 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  54.91 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  51.86 
 
 
327 aa  354  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
330 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  53.56 
 
 
324 aa  354  1e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
330 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
330 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
330 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 
330 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 
348 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  53.11 
 
 
328 aa  352  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  52.16 
 
 
328 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 
330 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.77 
 
 
327 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 
330 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 
330 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
328 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
330 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 
328 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 
331 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 
324 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 
333 aa  344  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
329 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 
328 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
329 aa  342  7e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  51.84 
 
 
337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  52.76 
 
 
337 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  55 
 
 
324 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  48.76 
 
 
334 aa  334  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
324 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  50.62 
 
 
328 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  55.17 
 
 
321 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 
326 aa  333  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 
321 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
330 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 
330 aa  330  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 
327 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 
327 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 
327 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.65 
 
 
331 aa  326  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  49.1 
 
 
332 aa  322  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 
324 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  49.07 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.02 
 
 
329 aa  319  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 
327 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
329 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
338 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  46.63 
 
 
329 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  46.6 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 
350 aa  311  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
328 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 
332 aa  311  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 
327 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  45.87 
 
 
339 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  47.08 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 
326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  47.99 
 
 
333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.19 
 
 
330 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  44.92 
 
 
331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  48.28 
 
 
330 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 
332 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  46.01 
 
 
330 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  46.46 
 
 
327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  44.86 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  48.42 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>