198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0047 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0044  tRNA-Pro  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0015  tRNA-Pro  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0316324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309349  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0004  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.14749  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0020  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309076  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309142  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309152  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309195  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  92.42 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0093  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0017  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0061005  normal  0.238616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0018  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.452658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0012  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0290089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0086  tRNA-Asn  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0075  tRNA-Pro  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0073  tRNA-Pro  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt38  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt38  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0039  tRNA-Pro  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000294906  hitchhiker  0.000684327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60200  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0034  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0293372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28740  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230263  hitchhiker  0.00000000587474 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1407  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2512  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0027  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0034  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  83.82 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0046  tRNA-Pro  86.76 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0117293  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna31  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184408  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>