37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5639 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 		 533 aa  1076    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  28.46 
 
 		 584 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  33.4 
 
 		 579 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  28.08 
 
 		 588 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.29 
 
 		 1349 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.13 
 
 		 1391 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  29.47 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.29 
 
 		 1570 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  29.22 
 
 		 568 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  27.76 
 
 		 585 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.06 
 
 		 580 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  29.42 
 
 		 568 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  27.81 
 
 		 692 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  27.61 
 
 		 595 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.79 
 
 		 584 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.79 
 
 		 639 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.71 
 
 		 585 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  23.35 
 
 		 587 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.55 
 
 		 572 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  20.58 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.04 
 
 		 589 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.86 
 
 		 567 aa  54.7  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  34.43 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.25 
 
 		 552 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.97 
 
 		 747 aa  51.2  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.97 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  30.5 
 
 		 587 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  23.7 
 
 		 574 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  28.57 
 
 		 599 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.27 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.2 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  22.86 
 
 		 543 aa  45.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  33.67 
 
 		 624 aa  44.3  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.77 
 
 		 592 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.22 
 
 		 561 aa  43.9  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>