More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5628 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  58.33 
 
 		 1172 aa  1205    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  50.13 
 
 		 1117 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  58.13 
 
 		 1172 aa  1197    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 1145 aa  2365    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  26.98 
 
 		 1000 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.98 
 
 		 775 aa  125  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  25.49 
 
 		 775 aa  121  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  30.8 
 
 		 777 aa  111  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  29.41 
 
 		 777 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  29.21 
 
 		 595 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  30.04 
 
 		 777 aa  108  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  30.04 
 
 		 777 aa  108  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  30.04 
 
 		 777 aa  108  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  29.08 
 
 		 776 aa  106  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  28.29 
 
 		 595 aa  105  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  26.94 
 
 		 605 aa  104  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  29.54 
 
 		 777 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  29.65 
 
 		 636 aa  96.3  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  25.56 
 
 		 477 aa  93.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  27.01 
 
 		 611 aa  91.3  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  25.12 
 
 		 600 aa  89.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  28.98 
 
 		 599 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  22.69 
 
 		 902 aa  87.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  25.44 
 
 		 626 aa  86.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  26.39 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  26.76 
 
 		 601 aa  84.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  29.02 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  23.71 
 
 		 604 aa  83.6  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  29.02 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  26.28 
 
 		 694 aa  82.4  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  27.55 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  27.67 
 
 		 604 aa  82.4  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  25.97 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  29.03 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  26.58 
 
 		 684 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  23.92 
 
 		 717 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  27.09 
 
 		 571 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  23.63 
 
 		 717 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  26.51 
 
 		 596 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  29.88 
 
 		 588 aa  79.7  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  26.53 
 
 		 682 aa  79.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  26.72 
 
 		 600 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  26.34 
 
 		 677 aa  79.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  23.77 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  23.21 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  26.59 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  27.09 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  26.74 
 
 		 771 aa  79  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  26.65 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  24.74 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  25.26 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  25.96 
 
 		 677 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  24.74 
 
 		 678 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  30.46 
 
 		 577 aa  77.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  25.9 
 
 		 677 aa  77  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  28.24 
 
 		 625 aa  76.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  25.83 
 
 		 634 aa  76.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  27.68 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  25 
 
 		 578 aa  75.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  27.32 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  26.81 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  26.51 
 
 		 624 aa  75.5  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  25.1 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  25.1 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  22.04 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  24.77 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  27.98 
 
 		 590 aa  74.3  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  26.76 
 
 		 660 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  25.73 
 
 		 646 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  25.73 
 
 		 646 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  25.15 
 
 		 637 aa  74.3  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  26.42 
 
 		 524 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  28.27 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  26.45 
 
 		 598 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  26.13 
 
 		 636 aa  73.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  26.32 
 
 		 656 aa  73.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  26.58 
 
 		 681 aa  73.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  25 
 
 		 828 aa  73.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  25.71 
 
 		 623 aa  72.8  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  22.34 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  27.23 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  28.53 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  25.91 
 
 		 655 aa  72.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  25.63 
 
 		 633 aa  72.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  26.52 
 
 		 507 aa  72  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  25.2 
 
 		 587 aa  72  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  23.66 
 
 		 463 aa  72  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  24.78 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  27.66 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  27.75 
 
 		 619 aa  71.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  27.27 
 
 		 573 aa  70.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  25.6 
 
 		 647 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  26.01 
 
 		 452 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>