More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5423 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  100 
 
 		 2805 aa  5758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0185  hypothetical protein  30 
 
 		 2581 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0318462 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0048  hypothetical protein  31.33 
 
 		 580 aa  254  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2492  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1188 aa  137  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0778449 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1495  ribonuclease H  45.39 
 
 		 146 aa  122  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1612  ribonuclease H  43.26 
 
 		 141 aa  120  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1808  ribonuclease H  45.45 
 
 		 146 aa  115  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1627  ribonuclease H  45.45 
 
 		 146 aa  115  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0579562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2025  ribonuclease H  43.45 
 
 		 143 aa  115  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2066  ribonuclease H  41.1 
 
 		 149 aa  115  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5424  hypothetical protein  46.72 
 
 		 126 aa  113  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1996  ribonuclease H  44.76 
 
 		 146 aa  114  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0049  hypothetical protein  25.14 
 
 		 712 aa  112  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  42.86 
 
 		 159 aa  111  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  41.1 
 
 		 159 aa  110  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1976  ribonuclease H  38.46 
 
 		 142 aa  108  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  42.21 
 
 		 269 aa  108  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  39.22 
 
 		 164 aa  107  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  42.25 
 
 		 149 aa  106  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  38.51 
 
 		 158 aa  105  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  44.2 
 
 		 159 aa  105  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  38.67 
 
 		 157 aa  104  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3858  hypothetical protein  31.14 
 
 		 343 aa  103  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  40.41 
 
 		 147 aa  103  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  37.5 
 
 		 147 aa  102  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  38.85 
 
 		 160 aa  102  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  38.06 
 
 		 155 aa  102  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  39.73 
 
 		 145 aa  102  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  40.14 
 
 		 145 aa  102  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  38.26 
 
 		 163 aa  102  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  42.76 
 
 		 145 aa  100  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  42 
 
 		 156 aa  100  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  38.78 
 
 		 154 aa  100  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  38.78 
 
 		 154 aa  100  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  38.19 
 
 		 156 aa  100  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  44.03 
 
 		 152 aa  99.8  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  42 
 
 		 158 aa  99  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  40 
 
 		 148 aa  99.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  37.84 
 
 		 153 aa  99.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  41.61 
 
 		 158 aa  99  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  41.61 
 
 		 158 aa  99  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  37.85 
 
 		 192 aa  97.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  38.1 
 
 		 153 aa  98.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  38.36 
 
 		 148 aa  98.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  42.86 
 
 		 146 aa  98.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  42.45 
 
 		 155 aa  98.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  40.28 
 
 		 142 aa  97.8  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  41.33 
 
 		 156 aa  97.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  41.33 
 
 		 156 aa  97.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  41.33 
 
 		 156 aa  97.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  41.96 
 
 		 158 aa  97.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1743  ribonuclease H  38.78 
 
 		 141 aa  97.4  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  41.33 
 
 		 156 aa  97.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  37.84 
 
 		 154 aa  97.1  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  37.84 
 
 		 154 aa  97.1  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  37.33 
 
 		 148 aa  96.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  37.33 
 
 		 148 aa  96.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  40 
 
 		 145 aa  96.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  37.33 
 
 		 148 aa  96.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  39.04 
 
 		 150 aa  96.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1101  ribonuclease H  38.16 
 
 		 245 aa  96.3  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  41.55 
 
 		 153 aa  96.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  36.81 
 
 		 146 aa  96.3  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  38.89 
 
 		 156 aa  96.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  37.09 
 
 		 150 aa  96.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  38.36 
 
 		 154 aa  95.9  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  38.89 
 
 		 156 aa  95.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  41.22 
 
 		 161 aa  95.5  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  39.86 
 
 		 151 aa  95.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  40 
 
 		 148 aa  95.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  39.57 
 
 		 157 aa  95.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  40.14 
 
 		 159 aa  95.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  39.31 
 
 		 155 aa  95.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  37.91 
 
 		 170 aa  95.5  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  37.41 
 
 		 150 aa  95.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  39.46 
 
 		 148 aa  94.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  38.36 
 
 		 154 aa  95.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  37.86 
 
 		 151 aa  94.7  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  33.73 
 
 		 245 aa  94.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  37.33 
 
 		 148 aa  94.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  39.44 
 
 		 155 aa  95.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  37.76 
 
 		 173 aa  94.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  38 
 
 		 152 aa  94.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  39.46 
 
 		 148 aa  94  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  36.99 
 
 		 143 aa  94  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  39.46 
 
 		 148 aa  94  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  39.46 
 
 		 146 aa  94  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  37.75 
 
 		 150 aa  94  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  39.46 
 
 		 148 aa  94  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  39.46 
 
 		 148 aa  94  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  38.19 
 
 		 148 aa  94  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  39.46 
 
 		 148 aa  94  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>