More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5420 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  50.85 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  53.27 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  53.27 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  49.06 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  52.43 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  51.46 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  47.27 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  51.46 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  49.52 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  50.98 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  43.59 
 
 		 120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  50.98 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  48.11 
 
 		 120 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  33.64 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  30.23 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  31.53 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  31.25 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  35.54 
 
 		 125 aa  66.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  30 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  35.54 
 
 		 125 aa  66.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  29.37 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  32.38 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  32.38 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  33.02 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  32.38 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  32.38 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  27.52 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  32.38 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  25.69 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  26.98 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  31.73 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  37.37 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  40 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  26.61 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  31.09 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  35.35 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  27.78 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  26.24 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  25.37 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  29.25 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  23.48 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  26.61 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  31.96 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  26.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  25.93 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  23.15 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  27.78 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  28.79 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  26.15 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  32.71 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  25 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  23.62 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  22.61 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  26.15 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  40 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  28.45 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  30.69 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  25.42 
 
 		 177 aa  57  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  33.04 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  26.02 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  27.93 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>