120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5405 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  100 
 
 
1073 aa  2196    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  41.39 
 
 
1308 aa  325  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  42.82 
 
 
782 aa  318  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  47.08 
 
 
813 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  44.18 
 
 
694 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5318  hypothetical protein  40.16 
 
 
550 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120389  normal  0.353542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  33.12 
 
 
902 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.25 
 
 
1240 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  33.11 
 
 
1699 aa  214  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.6 
 
 
1711 aa  212  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  33.91 
 
 
1344 aa  205  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
1078 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 
1334 aa  198  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  30.34 
 
 
1553 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 
1760 aa  196  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.09 
 
 
1823 aa  195  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.37 
 
 
1481 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  30.94 
 
 
1152 aa  195  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  31.26 
 
 
972 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.22 
 
 
1686 aa  191  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  32.73 
 
 
1157 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  28.18 
 
 
1265 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
973 aa  185  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  32.15 
 
 
1733 aa  184  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 
901 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  30.28 
 
 
1510 aa  181  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.74 
 
 
1599 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.1 
 
 
1236 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
969 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
969 aa  174  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 
897 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.11 
 
 
1623 aa  171  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  31.76 
 
 
1392 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
965 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
1032 aa  168  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
1046 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.82 
 
 
1583 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.21 
 
 
1607 aa  164  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.78 
 
 
1657 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.44 
 
 
1357 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  30.48 
 
 
1194 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.37 
 
 
1598 aa  157  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  27.99 
 
 
885 aa  157  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.89 
 
 
1547 aa  157  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.72 
 
 
1190 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.07 
 
 
1609 aa  155  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.43 
 
 
1398 aa  151  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  28.08 
 
 
1026 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 
1013 aa  148  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 
1005 aa  144  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.22 
 
 
1617 aa  144  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
1014 aa  144  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
1020 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
947 aa  141  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  28.12 
 
 
1230 aa  140  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0053  hypothetical protein  32.24 
 
 
750 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0689055  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  27.64 
 
 
1432 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
1353 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
1085 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.63 
 
 
1075 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  28 
 
 
1301 aa  126  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.56 
 
 
1267 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.1 
 
 
1684 aa  126  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  28.04 
 
 
1080 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  28.05 
 
 
1075 aa  125  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  29.66 
 
 
1401 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.43 
 
 
1355 aa  124  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.24 
 
 
1063 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  27.61 
 
 
1092 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.55 
 
 
1491 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  27.37 
 
 
1089 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  27.29 
 
 
1424 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  27.57 
 
 
1089 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  23.3 
 
 
1102 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  28.87 
 
 
994 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  27.16 
 
 
1067 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.87 
 
 
1626 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  27.05 
 
 
1075 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
1314 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  25.05 
 
 
1092 aa  111  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  23.58 
 
 
1124 aa  105  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  26.57 
 
 
787 aa  101  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  24.85 
 
 
1131 aa  100  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  24.68 
 
 
1074 aa  97.8  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 
1399 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0015  pentapeptide repeat-containing protein  48.35 
 
 
176 aa  97.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0778805  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  24.62 
 
 
544 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  24.23 
 
 
1183 aa  65.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  24.55 
 
 
823 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  23.75 
 
 
525 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
698 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.2 
 
 
1238 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  28.4 
 
 
559 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.07 
 
 
1552 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  24.33 
 
 
806 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  28.66 
 
 
569 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.91 
 
 
1789 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  26.32 
 
 
848 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.09 
 
 
1256 aa  58.9  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  27.78 
 
 
562 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>