106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5306 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5306  protein of unknown function DUF29  100 
 
 
150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0698  protein of unknown function DUF29  61.54 
 
 
150 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213059  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2944  protein of unknown function DUF29  54.29 
 
 
147 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3152  protein of unknown function DUF29  54.29 
 
 
147 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.039053  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1277  protein of unknown function DUF29  47.86 
 
 
158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1246  protein of unknown function DUF29  47.86 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0704  protein of unknown function DUF29  48.23 
 
 
153 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  0.581581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4304  protein of unknown function DUF29  48.18 
 
 
142 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2756  protein of unknown function DUF29  47.3 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4365  protein of unknown function DUF29  45.99 
 
 
142 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0780275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0651  protein of unknown function DUF29  47.83 
 
 
152 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0154198  normal  0.0872929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3967  protein of unknown function DUF29  46.81 
 
 
149 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1318  protein of unknown function DUF29  40.58 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3729  protein of unknown function DUF29  40.74 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5336  protein of unknown function DUF29  37.68 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3241  protein of unknown function DUF29  41.48 
 
 
161 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.249361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0255  protein of unknown function DUF29  41.89 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4105  protein of unknown function DUF29  38.03 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4913  protein of unknown function DUF29  36 
 
 
158 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.576904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1894  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2917  protein of unknown function DUF29  36.36 
 
 
146 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0975429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3205  protein of unknown function DUF29  36.36 
 
 
146 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0580  hypothetical protein  37.78 
 
 
144 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00000165262  n/a   
 
 
-
 
NC_009474  Acry_3636  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1360  protein of unknown function DUF29  41.43 
 
 
165 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2766  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0766  hypothetical protein  41.53 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000028887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3661  protein of unknown function DUF29  39.72 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216032  normal  0.996648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0845  protein of unknown function DUF29  41.79 
 
 
235 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.275216 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3625  hypothetical protein  33.81 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3727  protein of unknown function DUF29  39.69 
 
 
155 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2442  protein of unknown function DUF29  39.42 
 
 
155 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257531  normal  0.205428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3739  hypothetical protein  34.81 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5335  protein of unknown function DUF29  44 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5034  hypothetical protein  33.78 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2239  protein of unknown function DUF29  39.04 
 
 
152 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707792 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4999  hypothetical protein  36.23 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3642  protein of unknown function DUF29  39.04 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2472  protein of unknown function DUF29  39.04 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0330684  normal  0.567998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0542  hypothetical protein  30.34 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3699  hypothetical protein  31.16 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0539  hypothetical protein  34.78 
 
 
166 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2482  protein of unknown function DUF29  31.69 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0170652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0380  protein of unknown function DUF29  34.51 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0389  protein of unknown function DUF29  34.51 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0622  protein of unknown function DUF29  34.97 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1364  protein of unknown function DUF29  36.69 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1710  protein of unknown function DUF29  38.1 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000133374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0216  protein of unknown function DUF29  38.28 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1919  protein of unknown function DUF29  31.21 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0213  protein of unknown function DUF29  38.28 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000762882  decreased coverage  0.000484269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4036  hypothetical protein  35.04 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0191008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1841  protein of unknown function DUF29  37.7 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4411  protein of unknown function DUF29  33.85 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1378  protein of unknown function DUF29  36.17 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3342  protein of unknown function DUF29  35.56 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0809  protein of unknown function DUF29  35.86 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0014  protein of unknown function DUF29  34.29 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1050  protein of unknown function DUF29  36.17 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0264993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0838  protein of unknown function DUF29  35.86 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1741  protein of unknown function DUF29  32.26 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2916  protein of unknown function DUF29  33.82 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0548  protein of unknown function DUF29  29.68 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1808  hypothetical protein  43.9 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3972  protein of unknown function DUF29  31.51 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1740  protein of unknown function DUF29  29.68 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1459  protein of unknown function DUF29  30.97 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000787671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1267  protein of unknown function DUF29  26.92 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0944  protein of unknown function DUF29  30.94 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0100  protein of unknown function DUF29  37.01 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0935689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0971  protein of unknown function DUF29  30.94 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000575835  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1900  protein of unknown function DUF29  31.97 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1596  protein of unknown function DUF29  35.29 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00472481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1924  protein of unknown function DUF29  31.97 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.319193  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0602  protein of unknown function DUF29  33.57 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1266  protein of unknown function DUF29  29.03 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1408  protein of unknown function DUF29  32.84 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.835091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3570  hypothetical protein  32.35 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3741  protein of unknown function DUF29  34.75 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0890  protein of unknown function DUF29  28.99 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1918  protein of unknown function DUF29  29.32 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1412  protein of unknown function DUF29  35.85 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0144  protein of unknown function DUF29  29.2 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42277  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0148  protein of unknown function DUF29  29.2 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1237  protein of unknown function DUF29  26.06 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1418  protein of unknown function DUF29  28.57 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0013  protein of unknown function DUF29  28.47 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2015  protein of unknown function DUF29  30.14 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.298519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1988  protein of unknown function DUF29  30.14 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2489  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000894526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2565  protein of unknown function DUF29  26.67 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2146  protein of unknown function DUF29  28.87 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4927  protein of unknown function DUF29  30.25 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1506  protein of unknown function DUF29  27.78 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1533  protein of unknown function DUF29  27.78 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3658  protein of unknown function DUF29  29.17 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1914  hypothetical protein  38.1 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2916  protein of unknown function DUF29  40.35 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0704921  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2543  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1076  hypothetical protein  46.15 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>