More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5296 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  100 
 
 		 567 aa  1154    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  55.08 
 
 		 534 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  47.64 
 
 		 563 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  51.16 
 
 		 603 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  48.75 
 
 		 570 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  50.19 
 
 		 667 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  48.68 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  48.68 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  47.61 
 
 		 575 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  42.83 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  46.87 
 
 		 576 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  45.45 
 
 		 576 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  44.47 
 
 		 665 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  42.52 
 
 		 589 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  40.74 
 
 		 668 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  39.67 
 
 		 660 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  40.07 
 
 		 608 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  39.93 
 
 		 660 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  40.64 
 
 		 658 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 660 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  39.22 
 
 		 660 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  43.35 
 
 		 669 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  39.27 
 
 		 611 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  39.78 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  41.02 
 
 		 662 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  40.82 
 
 		 662 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  40.04 
 
 		 662 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  36.58 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.58 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  34.09 
 
 		 590 aa  332  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  36.44 
 
 		 595 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  35.59 
 
 		 575 aa  326  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  34.7 
 
 		 578 aa  317  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  34.65 
 
 		 589 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  34.47 
 
 		 589 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  34.47 
 
 		 589 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.29 
 
 		 589 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  34.4 
 
 		 571 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  34.47 
 
 		 589 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  34.29 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  32.58 
 
 		 621 aa  309  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 588 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 588 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  33.85 
 
 		 583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 584 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  33.27 
 
 		 589 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.68 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  34.09 
 
 		 614 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  34.12 
 
 		 586 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  33.57 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.69 
 
 		 598 aa  297  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  33.92 
 
 		 614 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  33.04 
 
 		 588 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  33.52 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  32.88 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  33.69 
 
 		 579 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  34.11 
 
 		 606 aa  293  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 639 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  34.57 
 
 		 605 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  33.83 
 
 		 713 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  31.13 
 
 		 610 aa  290  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  33.22 
 
 		 614 aa  289  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  32.47 
 
 		 595 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  34.36 
 
 		 606 aa  286  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  34.63 
 
 		 588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  32.91 
 
 		 583 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  32.73 
 
 		 630 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  30.84 
 
 		 597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  32.35 
 
 		 712 aa  283  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  32.84 
 
 		 596 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  34.74 
 
 		 602 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  34.55 
 
 		 626 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  34.55 
 
 		 615 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  30.26 
 
 		 613 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  31.51 
 
 		 614 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  30.5 
 
 		 636 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  30.5 
 
 		 634 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  30.5 
 
 		 636 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  35.61 
 
 		 572 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  32.64 
 
 		 712 aa  270  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  32.61 
 
 		 637 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  31.91 
 
 		 593 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  32.64 
 
 		 704 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  31.45 
 
 		 635 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 		 577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.2 
 
 		 599 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  33.01 
 
 		 708 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  32.56 
 
 		 704 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  30.26 
 
 		 660 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  30.27 
 
 		 701 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  31.15 
 
 		 561 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  31.42 
 
 		 563 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.64 
 
 		 561 aa  257  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  30.96 
 
 		 561 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  29.49 
 
 		 651 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>