23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5285 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3934  hypothetical protein  51.66 
 
 
279 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00016273  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  52.79 
 
 
306 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3424  hypothetical protein  52.42 
 
 
306 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0005  eight transmembrane protein EpsH, putative  38.17 
 
 
245 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  27.9 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  24.84 
 
 
508 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  27.87 
 
 
515 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  25.56 
 
 
533 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  25.6 
 
 
304 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  26.09 
 
 
529 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  29.03 
 
 
524 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  24.79 
 
 
514 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  24.86 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  23.32 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  26.42 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27.33 
 
 
497 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  24.47 
 
 
476 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  24.07 
 
 
528 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  25 
 
 
530 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  24.05 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  26.71 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  26.71 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>